Ключевая разница – протеомика и транскриптомика
Омическая технология – это современная тенденция, когда различные биомолекулы организма рассматриваются как единое целое в отношении его свойств и функций. Омическая технология имеет широкий спектр применений. Различные омики биологического образца включают геномику, протеомику, транскриптомику и метаболомику. Протеомика включает в себя полное изучение всех белков в живом организме. Его определяют как совокупность всех экспрессируемых белков в организме, их структурные и функциональные свойства. Таким образом, полный набор белков образует протеом. Транскриптомика - это полное изучение всех молекул информационной РНК (мРНК), присутствующих в живом организме. Таким образом, транскриптомика имеет дело с генами, которые активно экспрессируются в живом организме. Полный набор мРНК в живом организме называется транскриптомом. Ключевое различие между протеомикой и транскриптомикой основано на типе биомолекулы. В протеомике изучается общий набор экспрессируемых белков в живом организме, тогда как в транскриптомике изучается общая мРНК живого организма.
Что такое протеомика?
Термин протеомика был придуман в 1995 году и первоначально определялся как совокупность белков в клетке, ткани или организме. С развитием протеомных исследований он был изменен, чтобы его можно было рассматривать как общий термин, в который были включены многие области исследований. В настоящее время в рамках темы протеомики изучаются структура, ориентация, функции, ее взаимодействия, ее модификации, ее приложения и важность белков. Поэтому в настоящее время проводится много исследований в области протеомики.
Первые протеомные исследования были проведены для определения содержания белка в кишечной палочке. Картирование общего содержания белка проводили с использованием двумерных (2D) гелей. После успеха ученые перешли к характеристике общего содержания белка у животных, таких как морские свинки и мыши. В настоящее время картирование белков человека проводится с помощью двумерного гель-электрофореза.
Применения протеомики
Изучение протеомики имеет много преимуществ, поскольку белки являются управляющими молекулами большей части активности из-за каталитических свойств белков. Таким образом, изучение цельных белков может дать информацию о состоянии здоровья организма. Некоторые приложения:
- Аннотация генома: Изучая содержание белка в организме, можно определить точные геномы, ответственные за активное белковое соединение. В этом сценарии важны результаты всей геномики, транскриптомики и протеомики.
- Идентификация болезни/Диагностика: Протеомика используется для идентификации болезненного состояния путем сравнения здоровых и больных
- Для проведения экспрессии белков, изученных в ходе экспериментов.
- Изучения модификаций белков и взаимодействия: чтобы использовать белки в условиях in vitro или in vivo, определить условия хранения этих экстрагированных белков и изучить поведение белка in vitro, in vivo и in vivo. – силиконовые методы.
Рисунок 01: Протеомика
В протеомике используются разные техники
- Выделение общего белка и разделение белков с помощью двумерного гель-электрофореза. Белки также можно разделить с помощью высокоэффективной жидкостной хроматографии (ВЭЖХ).
- Секвенирование выделенных белков с использованием таких методов, как метод секвенирования Эдмунда или масс-спектрометрия.
- После идентификации последовательностей структурные и функциональные свойства белка анализируются с использованием компьютерного программного обеспечения и инструментов биоинформатики.
Что такое транскриптомика?
Термин «транскриптом» появился недавно. Транскриптомика - это исследование общего содержания мРНК в организме. Суммарная мРНК представляет собой экспрессированную ДНК в живом организме или клетке. Полный набор мРНК называется транскриптомом.
Этапы анализа транскриптома включают,
- Выделение РНК, разделение мРНК с помощью колоночной гель-хроматографии с гранулами поли-DT.
- Секвенирование мРНК завершено.
Технология микрочипов является одним из распространенных способов идентификации транскриптома организма. Техника микрочипов включает в себя зондовую пластину с комплементарными цепями транскриптома. При гибридизации можно охарактеризовать мРНК, присутствующую в организме или клетках.
Рисунок 02: Методы транскриптомики
Транскриптомика сейчас широко используется в медицинской сфере. Диагностика заболеваний и составление профилей заболеваний являются основными областями, в которых используется транскриптомика. При анализе транскриптома организма можно идентифицировать чужеродную мРНК, а при наличии инфекций - идентифицировать. Некодирующую РНК можно разделить с помощью транскриптомных технологий. А также можно отслеживать экспрессию генов при различных экологических стрессах.
Каковы сходства между протеомикой и транскриптомикой?
- Оба являются частью концепции омической технологии.
- Оба используются в диагностике заболеваний и характеристике заболеваний организма.
- Обе области исследования включали выделение биомолекулы, разделение биомолекулы и этапы секвенирования.
В чем разница между протеомикой и транскриптомикой?
Протемика против транскриптомики |
|
| Протеомика включает полное изучение всех белков в живом организме. | Транскриптомика – это полное исследование всех молекул информационной РНК (мРНК), присутствующих в живом организме. |
| Изучаемый тип биомолекулы | |
| Белки изучаются в протеомике. | мРНК изучаются в транскриптомике. |
| Изученные факторы | |
| Структура, функции, взаимодействия, модификации и применение белков изучаются в протеомике. | Структура последовательности, взаимодействие с окружающей средой и применение мРНК изучаются в транскриптомике. |
Резюме – Протеомика против транскриптомики
Омики играют важную роль в области наук о жизни. Протеомика относится к изучению протеома, который формирует полные наборы белков в клетке или организме. Транскриптомика относится к изучению транскриптома, который представляет собой полный набор экспрессированной ДНК в форме мРНК. Две области исследований, протеомика и транскриптомика, возникли после введения геномики и в настоящее время широко используются в медицинской диагностике, а также в характеристике и скрининге организмов. В этом разница между протеомикой и транскриптомикой.
Загрузить PDF-файл Proteomics vs Transcriptomics
Вы можете загрузить PDF-версию этой статьи и использовать ее в автономном режиме в соответствии с примечанием к цитированию. Пожалуйста, загрузите PDF-версию здесь: Разница между протеомикой и транскриптомикой
