Ключевое различие между целевой и нецелевой протеомикой заключается в том, что целевая протеомика нацелена на измерение распространенности определенного белка, в то время как нецелевая протеомика не нацелена на конкретный белок.
Протеомика - это широкомасштабное изучение белков, их структур и функций. Он изучает весь белковый набор в клетке, ткани или организме в определенных условиях. Существует два типа протеомики: целевая протеомика и нецелевая протеомика.
Что такое целевая протеомика?
Как видно из названия, целевая протеомика нацелена на анализ определенного белка или пептида в сложной смеси белков. Затем он анализирует наличие и количество этого предварительно выбранного конкретного белка. Этот метод возможен только для одного образца или для нескольких образцов. Этот метод подходит даже для определенной группы белков. Это приводит к более точным, количественным и конфиденциальным данным. Более того, масс-спектрометрия в сочетании с целенаправленной протеомикой дает более точные и надежные измерения. В этом методе для анализа используется тройной квадрупольный масс-спектрометр (QQQ).
Рисунок 01: Протеомика
Целевая протеомика является подходящим методом, если вы хотите проверить, действительно ли нокдаун-мишень сбит, или когда вы хотите количественно определить конкретный белок/пептид в сыворотке крови, мозговой жидкости или в клеточном лизате и т. д. Вы также можете используйте его, если вы хотите проверить, по-разному экспрессируется ли конкретный белок в образцах или во время эксперимента.
Что такое нецелевая протеомика?
Нецелевая протеомика, как следует из названия, не нацелена на конкретный белок или пептид для его анализа. Протеомика открытий - это другое название нецелевой протеомики. На самом деле это более «глобальный» анализ. Как правило, выполнение нецелевой протеомики заключается в ответе на вопрос «какой белок или белки присутствуют в этом образце или нескольких образцах?». Этот метод не является чувствительным, как таргетная протеомика. Но он может идентифицировать и измерять многие белки, включая новые белки. Нецелевая протеомика может производить как количественные, так и качественные измерения.
Каковы сходства между целевой и нецелевой протеомикой?
- Как целевая, так и нецелевая протеомика измеряют белки в образцах.
- Они важны для анализа протеома.
- В этих методах используется масс-спектрометрия.
В чем разница между целевой и нецелевой протеомикой?
Во-первых, целевая протеомика – это определение наличия и количества определенного белка или пептида в сложной смеси белков. Напротив, нецелевая протеомика - это количественное и качественное исследование белков, присутствующих в образце или образцах, без нацеливания на конкретный белок. Целевая протеомика выполняется с предварительно выбранными или целевыми белками, в то время как нецелевая протеомика выполняется для определения типов белков в этом образце. Более того, целевая протеомика более чувствительна, чем нецелевая протеомика.
Резюме – Целевая и нецелевая протеомика
Подводя итог, можно сказать, что целевая и нецелевая протеомика - это два типа исследований белка. Как следует из их названий, целевая протеомика нацелена на конкретный белок, в то время как нецелевая протеомика не нацелена на конкретный белок. В этом разница между целевой и нецелевой протеомикой.
