Ключевое различие между окрашиванием кумасси и серебром заключается в том, что окрашивание кумасси - это метод окрашивания белка, в котором используется краситель кумасси бриллиантовый синий, а окрашивание серебрянкой - это метод окрашивания белка, в котором используется краситель серебра.
Разделение и идентификация белков являются важными этапами анализа протеома. Им необходима характеристика белков с высоким разрешением после гель-электрофореза. Существует множество методов окрашивания, которые включают в себя различные красители, такие как анионные красители (кумасси бриллиантовый синий), катионы металлов (имидазол-цинк), серебряное пятно и флуоресцентные красители и т. д. Иногда также можно использовать радиоактивные зонды. Выбор техники окрашивания зависит от простоты, наличия в лаборатории оборудования для визуализации и т. д.
Что такое окрашивание кумасси?
Окрашивание кумасси - это метод окрашивания белков, в котором используется краситель кумасси бриллиантовый синий. Это обычно называется техникой синего кумасси. Кумасси бриллиантовый синий - самый популярный анионный белковый краситель. Этот краситель обычно окрашивает почти все белки с хорошей количественной линейностью при средней чувствительности. Краситель кумасси бриллиантовый синий неспецифически связывается почти со всеми белками. Существует два разных варианта окрашивания кумасси бриллиантовым синим: R-250 и G-250. R-250 обеспечивает более короткое время окрашивания, а G-250 доступен в более чувствительных и экологически безопасных составах.
Рисунок 01: Окрашивание кумасси
Кумасси красители очень популярны в масс-спектрометрических исследованиях и исследованиях идентификации белков. Кроме того, биобезопасный краситель кумасси представляет собой неопасную формулу кумасси синего G-250, которая в настоящее время доступна на рынке. Преимущество этого состава в том, что для ополаскивания и удаления пятен требуется только вода. Биобезопасный краситель кумасси обеспечивает чувствительность, эквивалентную обычному красителю кумасси синий G-250, но лучше, чем краситель кумасси R-250. Кроме того, у него более простой и быстрый протокол окрашивания, чем у обычного кумасси синего G-250. Недостатком окрашивания кумасси синим является то, что оно менее чувствительно по сравнению с окрашиванием серебром. Окрашивание кумасси синим примерно в 50 раз менее чувствительно, чем окрашивание серебром. Однако из-за простоты связывания он предпочтительнее во многих исследованиях.
Что такое окрашивание серебром?
Окрашивание серебром - это метод окрашивания белков, в котором используется окрашивание серебром. Окрашивание серебром используется для окрашивания как агарозных, так и полиакриламидных гелей. Окрашивание белка серебром в агарозных гелях было впервые разработано в 1973 году Кереньи и Галлясом. Позже он был адаптирован для белков в полиакриламидных гелях, используемых в SDS-PAGE. В настоящее время окрашивание серебром также используется для окрашивания ДНК или РНК. Для окрашивания гелей в этом методе гели инкубируют с раствором нитрата серебра. Окрашивание серебром окрашивает места, где присутствуют белки, от коричневого до черного.
Рисунок 02: Окрашивание серебром
Интенсивность окрашивания серебром зависит от первичной структуры белка. Кроме того, чистота используемых сосудов и чистота реагентов также могут влиять на качество окрашивания серебром. Однако недостатком окрашивания серебром является то, что оно не может обнаружить все белки, особенно гликопротеины и белки с большими модифицированными группами, присоединенными к их боковым цепям.
Каковы сходства между кумасси и окрашиванием серебром?
- Окрашивание кумасси и серебром - два метода, используемые для окрашивания белков.
- Они могут окрашивать как белки, так и ДНК.
- Оба метода окрашивания имеют недостатки.
- Эти методы имеют схожие этапы, такие как фиксация, окрашивание и обесцвечивание.
В чем разница между окрашиванием кумасси и серебром?
Окрашивание кумасси - это метод окрашивания белков, в котором используется краситель кумасси бриллиантовый синий, а окрашивание серебрянкой - это метод окрашивания белков, в котором используется краситель серебром. Таким образом, в этом ключевое различие между окрашиванием кумасси и серебром. Кроме того, окрашивание кумасси менее чувствительно, чем окрашивание серебром.
Приведенная ниже инфографика перечисляет различия между окрашиванием кумасси и серебром в табличной форме для параллельного сравнения.
Резюме – Кумасси против окрашивания серебром
Для визуализации белков можно провести специфичную для белка химическую реакцию связывания красителя или получения цвета. Это называется белковым окрашиванием. Окрашивание кумасси и серебром - это два метода, используемые для окрашивания белков. В методе окрашивания кумасси используется краситель кумасси бриллиантовый синий, а в окрашивании ленты используется краситель серебром. Итак, в этом ключевое отличие окрашивания кумасси от окрашивания серебром.
