Ключевая разница - исходящая и нисходящая ДНК
Важно иметь общие знания о составе и структуре ДНК, чтобы понять разницу между восходящей и нисходящей ДНК. ДНК состоит из полинуклеотидных цепей. Нуклеотиды являются строительными блоками, которые создают полинуклеотидные цепи, и каждый нуклеотид состоит из трех компонентов: пятиуглеродного сахара, азотистого основания и фосфатной группы. Фосфатная группа и группа ОН присоединены к углероду в 5'-положении и 3'-положению углерода молекулы сахара в нуклеотиде соответственно. Нуклеотиды соединены между собой фосфодиэфирными связями, образованными между 5'-фосфатной группой одного нуклеотида и 3'-ОН-группой соседнего нуклеотида. Если полинуклеотидная цепь имеет свободную 5'-фосфатную группу, ее относят к 5'-концу; если у него есть свободная 3'-группа ОН, она назначается как 3'-конец. Следовательно, нити ДНК обычно имеют 5’- и 3’-концы в соответствии с конечными положениями полинуклеотидных цепей. ДНК также существует в виде двухцепочечной формы. Две нити антипараллельны друг другу. Следовательно, ДНК имеет две нити, которые проходят в направлении от 5’ к 3’ и от 3’ к 5’. Выше и ниже по течению ДНК упоминаются в отношении транскрипции и синтеза 5'-3' цепи мРНК. Если ДНК рассматривать ближе к концу кодирующей цепи от сайта инициации транскрипции, она известна как восходящая ДНК. Если ДНК рассматривать ближе к 3'-концу от кодирующей цепи от сайта инициации транскрипции, это называется ДНК ниже по течению. В этом ключевое различие между вышестоящей и нижестоящей ДНК.
Что такое Upstream DNA?
Ген – структурно-функциональная единица наследственности, расположенная в ДНК организма. Он хранится вместе с инструкциями по созданию белка. Ген имеет специфический участок молекулы ДНК. При необходимости он транскрибируется и транслируется в белок посредством синтеза цепи мРНК. Обычно кодирующая цепь гена идет от 5’ к 3’ направлению. Когда он транскрибируется, он производит цепь мРНК в том же направлении от 5’ к 3’. Во время транскрипции антисмысловая цепь с 3’ по 5’ служит матричной цепью и инициирует синтез мРНК. В гене имеется сайт инициации транскрипции. Что касается сайта инициации транскрипции, область ДНК ближе к 5'-концу кодирующей цепи известна как восходящая ДНК. Промотор гена обычно расположен в восходящей области ДНК. В эукариотических генах есть ТАТА-боксы, проксимальные элементы промотора и энхансеры в области перед геном. Вышерасположенная область гена обозначена отрицательными числами. Вышележащая ДНК гена имеет первостепенное значение для транскрипции.
Что такое Downstream DNA?
Участок инициации транскрипции известен как точка +1 гена. Участок ДНК от точки +1 к 3'-концу кодирующей цепи известен как нисходящая ДНК. Другими словами, ниже гена находится от сайта инициации транскрипции к 5'-концу цепи матрицы. Следовательно, расположенная ниже ДНК области гена включает транскрипционную единицу и другие последовательности, такие как терминаторная последовательность. Промотор может влиять на расположенную ниже последовательность гена. Нижняя часть гена обозначается положительными числами. Нижняя часть ДНК гена - это фактическая область, которая дает белковый продукт.
Рисунок 01: Восходящая и нисходящая ДНК
В чем разница между восходящей и нисходящей ДНК?
ДНК вверх по течению и вниз по течению |
|
| Участок ДНК ближе к 5’-концу кодирующей последовательности от сайта инициации транскрипции известен как восходящая ДНК. | Участок ДНК ближе к 3’-концу кодирующей цепи от сайта инициации транскрипции известен как нижестоящая ДНК. |
| Элементы | |
| Промоторы и энхансеры расположены на восходящей ДНК | Транскрипционная единица и терминаторные последовательности расположены в нижней части ДНК. |
| Нумерация | |
| Нуклеотиды в вышестоящей области обозначаются отрицательными числами | Нуклеотиды обозначаются положительными числами. |
| Функция | |
| Эта область содержит элементы, необходимые для регуляции и инициации транскрипции | Эта область содержит инструкции по производству белка и терминации транскрипции |
Резюме – вышестоящая и нижестоящая ДНК
Легко идентифицировать выше и ниже цепи РНК. Что касается эталонного сайта, область ближе к 5'-концу цепи РНК известна как восходящая РНК, тогда как область к 3'-концу известна как нижестоящая РНК. Однако в ДНК есть две нити, которые идут в обоих направлениях от 5’ к 3’ и от 3’ к 5’. Следовательно, разница между восходящей и нисходящей ДНК сложна. Следовательно, он дифференцируется в отношении транскрипции гена. От сайта инициации транскрипции к 5-му концу смысловой цепи участок ДНК известен как восходящая ДНК, тогда как от сайта инициации транскрипции к 3'-концу смысловой нити известен как нисходящая ДНК. В этом разница между восходящим и нисходящим потоком ДНК.
