Разница между метаболомикой и метабономикой

Оглавление:

Разница между метаболомикой и метабономикой
Разница между метаболомикой и метабономикой

Видео: Разница между метаболомикой и метабономикой

Видео: Разница между метаболомикой и метабономикой
Видео: Лекция 2. Обзор методов метаболомики (ЯМР, ГХ-МС, ВЭЖХ-МС) 2024, Июль
Anonim

Ключевая разница - метаболомика против метабономики

Метаболиты – это небольшие молекулы, участвующие в метаболических реакциях в клетках. К метаболитам относятся метаболические интермедиаты, гормоны, вторичные метаболиты, сигнальные молекулы и т. д. Они представляют собой функционирующие молекулы биохимических реакций клеток. Полный набор метаболитов биологического образца или отдельного организма известен как метаболом. Метаболома - это динамическая коллекция, которая каждую секунду меняется в организме. Метаболомика и метабономика - два термина, относящиеся к изучению метаболома организма. Ключевое различие между метаболомикой и метабономикой заключается в том, что метаболомика больше занимается нормальным эндогенным метаболизмом и метаболическим профилированием на клеточном или органном уровне, в то время как метабономика больше занимается расширением метаболического профилирования с информацией о нарушениях метаболизма из-за факторов окружающей среды, болезней, кишечника. микроорганизмы и сравнение метаболического профилирования и т. д. Метаболомика в основном основана на масс-спектрометрии, а метабономика использует ЯМР-спектроскопию для анализа метаболитов.

Что такое метаболомика?

Метаболомика – это изучение метаболических процессов, происходящих в клетках, биожидкостях, тканях или организмах. Он включает в себя идентификацию и количественную оценку клеточных метаболитов с использованием хороших аналитических и статистических инструментов. Метаболомика считается важным исследованием, поскольку оно раскрывает информацию об обмене веществ в организме.

Для изучения субстратов и продуктов метаболических реакций метаболомика использует в качестве аналитической платформы масс-спектрометрию. Масс-спектрометрия выявляет типы метаболитов и их концентрации, отражая реальное биохимическое состояние клеток или тканей. Следовательно, метаболомику можно считать лучшим представителем молекулярного фенотипа организма. Метаболомика представляет собой омическую технологию малых молекул организмов по сравнению с другими омическими исследованиями; метаболомика очень важна, так как она непосредственно отражает текущее состояние биохимических реакций клеток.

Метаболомика также может рассматриваться как расширение протеомики, поскольку она возникает благодаря активности ферментов, которые представляют собой белки, как показано на следующем рисунке.

Разница между метаболомикой и метабономикой
Разница между метаболомикой и метабономикой

Рисунок 01: Схема метаболизма

Что такое метабономика?

Метабономика определяется как количественное измерение многопараметрических метаболических реакций в определенное время в связи с патофизиологическими стрессами или генетической модификацией. Обычно это применяется к исследованиям, посвященным питанию человека и реакции на лекарства или болезни. Впервые этот подход был предложен Джереми Николсоном из Имперского колледжа в Лондоне, и он использовался в ряде областей, включая токсикологию, диагностику заболеваний, питание и т. д. Исторически сложилось так, что метабономика была одним из первых методов, применявших системную биологию в исследованиях. метаболизма.

Метабономика больше занимается сравнением биохимических профилей, чем идентификацией отдельных метаболических соединений в метаболомике. Следовательно, метабономику можно определить как подмножество метаболомики. Основное внимание уделяется сравнению метаболических профилей различных групп населения в отношении болезней, экологических стрессов, генетических модификаций, питания, лекарств и т. д., поскольку метаболиты являются хорошими маркерами, которые сигнализируют о болезненных состояниях, воздействии лекарств, экологических стрессах, воздействии токсинов. и т.д.

Метабономические исследования выявляют как внутриклеточные, так и внеклеточные метаболиты. Он использует высокопроизводительные методы для одновременного и многократного анализа большого количества метаболитов, что позволяет проводить временное исследование физиологического состояния клеток. Также выявляется корреляция между метаболитами и патологическим статусом организма. Для поддержки метабономических исследований можно использовать геномику и протеомику, поскольку они взаимосвязаны, как показано на рисунке выше.

В чем разница между Метаболомикой и Метабономикой?

Метаболомика против метабономики

Метаболомика – это изучение полного набора метаболитов организма Метабономика – это количественное исследование многопараметрических метаболических реакций живых систем на временной основе на патофизиологические стимулы или генетические модификации.
Главная проблема
Метаболомика больше занимается метаболическим профилированием и идентификацией отдельных метаболитов, присутствующих в клетках. Метабономика больше занимается сравнением метаболитов или метаболических профилей популяций по отношению к генетическим модификациям, болезням, экологическим стрессам, патологическим стимулам, лекарствам и т. д.
Информация
Метаболомика в основном сосредоточена на эндогенном метаболизме. Метабономика не ограничивается эндогенным метаболизмом. Он распространяется на поиск информации о нарушениях обмена веществ, вызванных внутренними и внешними факторами, такими как режим питания, токсины, болезненные процессы и т. д.
Аналитические инструменты
В качестве основной аналитической платформы используется масс-спектрометрия Метабономика использует спектроскопию ЯМР в качестве основной аналитической платформы.

Резюме – Метаболомика против метабономики

Метаболом представляет собой полный набор малых молекул, называемых метаболитами, присутствующих в клетке или в организме. Метаболомика - это исследование всего метаболома для создания метаболического профиля. Метаболомика позволяет ученым измерить реальный физиологический статус клетки или организма. Метабономика является частью метаболомики, которая распространяется на получение информации о многопараметрических метаболических реакциях живых систем на патофизиологические стимулы и генетические модификации. Метабономика занимается не только индивидуальным метаболическим профилированием, как метаболомика; он сравнивает метаболические профили по отношению к другим факторам, таким как экологические стрессы, болезни, токсины и т. д. И метаболомика, и метабономика включают исследования метаболитов организмов для измерения фактического физиологического состояния клеток. Следовательно, иногда эти два понятия рассматриваются как синонимы, не учитывая различия между метаболомикой и метабономикой.

Рекомендуемые: