Ключевое различие между FISH и CGH заключается в том, что FISH - это молекулярный метод, который обнаруживает специфическую последовательность ДНК на хромосоме с использованием флуоресцентно меченных зондов, в то время как CGH - это еще один молекулярно-цитогенетический метод, который обнаруживает изменения в геномной ДНК.
Цитогенетический анализ играет важную роль в медицине при выявлении хромосомных аномалий, таких как анеуплоидии, делеции, дупликации, перестройки и др. Хромосомные аномалии в итоге приводят к генетическим заболеваниям, таким как рак, бесплодие, синдром Дауна, синдром Клайнфельтера, Тернера синдром, лейкемия и др. Существуют различные молекулярно-цитогенетические методы выявления вышеперечисленных пороков и заболеваний. Среди них FISH (флуоресцентная гибридизация in situ) и CGH (сравнительная геномная гибридизация) являются двумя мощными методами гибридизации. Однако оба метода имеют свои плюсы и минусы.
Что такое РЫБА?
FISH представляет собой метод гибридизации нуклеиновых кислот, выполняемый на части или срезе ткани, на всей ткани или клетках. Это зондовый метод. Этот метод основан на теории комплементарного спаривания оснований Уотсона Крика, что приводит либо к гибридам ДНК-ДНК, либо к гибридам ДНК-РНК, которые, таким образом, могут обнаруживать мутировавшие гены или могут идентифицировать интересующий ген. Кроме того, в этом методе используются последовательности одноцепочечной ДНК, последовательности двухцепочечной ДНК, последовательности одноцепочечной РНК или синтетические олигонуклеотиды, полученные с использованием ник-трансляции, в качестве зондов, комплементарных интересующим последовательностям генов. Кроме того, важнейшей особенностью этого метода является мечение зондов флуоресцентными красителями. Таким образом, зонды связываются с комплементарными частями хромосомы и облегчают ее обнаружение.
Кроме того, FISH является высокочувствительным и специфичным методом. Следовательно, это распространенный метод как при исследовании, так и при диагностике гематологических злокачественных новообразований и солидных опухолей. Но FISH показывает низкое разрешение. Также требуется предварительное знание целевой аномалии для разработки последовательностей зондов.
Рисунок 01: РЫБА
Есть много применений FISH, в основном в молекулярной диагностике инфекционных заболеваний для выявления наличия патогенов и подтверждения патогена с помощью молекулярной диагностики. Кроме того, метод FISH широко используется в области биологии развития, кариотипирования и филогенетического анализа, а также физического картирования хромосом.
Что такое CGH?
Сравнительная геномная гибридизация (CGH) - это еще один метод молекулярной цитогенетики, основанный на ДНК, который может обнаруживать изменения последовательностей геномной ДНК. Этот метод представляет собой передовой метод, который может анализировать модификации хромосом и генов для обнаружения изменений или альтераций в последовательностях геномной ДНК. Кроме того, CGH требует выделения и фрагментации ДНК из экспериментального образца и эталонного образца. Затем образцы следует пометить двумя разными флуоресцентными красителями (обычно красным и зеленым). Позже оба образца смешивают и допускают к конкурентной гибридизации. Последним этапом является анализ образцов на наличие изменений в ДНК, таких как дупликация генов, потеря генов и т. д. В частности, он измеряет разницу в количестве копий ДНК между тестовым образцом и контрольным образцом.
Рисунок 02: CGH
Теперь доступна еще одна версия CGH; это более продвинутый метод, чем обычный CGH. Это метод, называемый CGH на основе массива или aCGH. aCGH позволяет точно идентифицировать делеции гена или последовательности во многих тысячах последовательностей в одном эксперименте.
Каковы сходства между FISH и CGH?
- FISH и CGH - это два молекулярных метода.
- И FISH, и CGH основаны на гибридизации нуклеиновых кислот.
- Кроме того, оба метода нуждаются в специально разработанных зондах для обнаружения конкретных ДНК-мишеней.
- Мы используем их для пренатальной и постнатальной диагностики генетических заболеваний.
- Кроме того, и FISH, и CGH являются очень мощными инструментами для изучения геномных изменений.
- Они используют флуоресцентные красители для маркировки зондов.
В чем разница между FISH и CGH?
FISH - это процедура гибридизации in situ, в которой используются флуоресцентные зонды для обнаружения определенных последовательностей ДНК, а CGH - это метод молекулярной гибридизации, который обнаруживает изменения последовательностей геномной ДНК. Итак, в этом ключевое отличие FISH от CGH.
Более того, FISH требует предварительных знаний о целевой аномалии для разработки последовательностей зондов, в то время как CGH не требует предварительных знаний. Кроме того, еще одно различие между FISH и CGH заключается в том, что FISH показывает ограниченное разрешение, в то время как aCGH показывает высокое разрешение.
Приведенная ниже инфографика суммирует разницу между FISH и CGH.
Резюме – FISH против CGH
FISH и CGH - это два молекулярно-цитогенетических метода, которые облегчают обнаружение представляющих интерес последовательностей генов. FISH облегчает обнаружение специфической последовательности ДНК на хромосоме с использованием флуоресцентно меченных зондов, в то время как CGH облегчает обнаружение изменений в геномной ДНК. Итак, в этом ключевое отличие FISH от CGH.
