Ключевое различие между CGH и массивом CGH заключается в том, что CGH - это традиционный молекулярно-цитогенетический метод анализа вариаций числа копий в ДНК тестового образца с более низким разрешением, тогда как массив CGH - это полностью автоматизированный молекулярно-цитогенетический метод для анализ изменения количества копий в ДНК тестового образца с более высоким разрешением.
CGH и массив CGH - это два метода обнаружения вариаций количества копий у людей. Вариация числа копий относится к участкам генома, которые повторяются. Количество копий варьируется от человека к человеку. Варианты количества копий обычно делятся на две группы: короткие повторы и длинные повторы. Одним из наиболее известных примеров коротких вариаций числа копий является повтор тринуклеотида CAG в гене хантингтина. Это вызывает неврологическое расстройство, называемое гентингтином. Лучшим примером изменения числа копий с длинными повторами является ген альфа-амилазы, вызывающий резистентность к инсулину. Изменение количества копий можно обнаружить с помощью таких методов, как FISH, CGH и массив CGH.
Что такое CGH?
CGH - это традиционный молекулярно-цитогенетический метод анализа вариаций числа копий в ДНК тестового образца по сравнению с эталонным образцом. Он имеет более низкое разрешение по сравнению с автоматизированными методами. Целью этого метода является быстрое и эффективное сравнение двух образцов геномной ДНК, полученных из разных источников.
Рисунок 01: CGH
Процедура предполагает выделение ДНК из двух источников: тестового и эталонного. Затем следующим шагом является независимое мечение тестовых и эталонных образцов ДНК флуорофорами разного цвета. Позже два образца ДНК были денатурированы, чтобы получить образцы одноцепочечной ДНК. Наконец, проводили гибридизацию двух полученных образцов ДНК в соотношении 1:1 с нормальным метафазным распространением хромосом. Хромосомные различия между двумя источниками можно определить с помощью флуоресцентного микроскопа и компьютерного программного обеспечения. Кроме того, метод CGH способен обнаруживать только несбалансированные хромосомные аномалии.
Что такое массив CGH?
Array CGH - это полностью автоматизированный молекулярно-цитогенетический метод анализа вариаций количества копий в ДНК тестового образца по сравнению с эталонным образцом. Он имеет более высокое разрешение и был разработан, чтобы свести к минимуму ограничения традиционной CGH. Array CGH сочетает в себе принципы CGH с использованием микрочипов. Вместо использования распространения метафазных хромосом в этом методе в качестве мишеней используются слайды с небольшими сегментами ДНК. Эти микроматрицы были изготовлены путем нанесения и иммобилизации небольшого количества ДНК (зондов) на твердую стеклянную подложку. Размер зондов может варьироваться от олигонуклеотида до бактериальной искусственной хромосомы.
Рисунок 02: Массив CGH
Независимо от зондов, базовый метод массива CGH аналогичен CGH. После приготовления зондов, содержащих микрочип, два образца ДНК (испытуемый и эталонный), помеченные флуорофорами разных цветов, смешивают вместе и добавляют к микрочипу. Поскольку ДНК в образцах является одноцепочечной из-за денатурации, эта ДНК гибридизуется с упорядоченными одноцепочечными зондами. Используя систему цифровой обработки изображений, можно определить хромосомные различия между двумя источниками.
В чем сходство между CGH и массивом CGH?
- CGH и массив CGH - это два метода обнаружения вариаций числа копий.
- Это молекулярно-цитогенетические методы.
- Оба метода диагностируют несбалансированные хромосомные аномалии.
- Флуорофоры участвуют в обоих методах.
- Оба метода могут использоваться для выявления генетических нарушений из-за вариаций числа копий.
- Они широко используются в сравнительном геномном анализе.
В чем разница между CGH и Array CGH?
CGH - это традиционный молекулярно-цитогенетический метод анализа вариаций числа копий в ДНК тестового образца с более низким разрешением, тогда как массив CGH - это полностью автоматизированный молекулярно-цитогенетический метод анализа вариаций числа копий в ДНК тестового образца. который имеет более высокое разрешение. Итак, в этом ключевое отличие CGH от массива CGH. Кроме того, в CGH тестовые и эталонные образцы ДНК гибридизуются с нормальным метафазным распространением хромосом, но в матричном CGH тестовые и эталонные образцы ДНК гибридизуются с иммобилизованными ДНК-зондами, содержащими микроматрицу.
В приведенной ниже инфографике перечислены различия между CGH и массивом CGH в табличной форме для параллельного сравнения.
Резюме – CGH против массива CGH
CGH и массив CGH - это два молекулярно-цитогенетических метода для выявления несбалансированных хромосомных аномалий. Они широко используются в сравнительном геномном анализе. CGH - это традиционный молекулярно-цитогенетический метод анализа вариаций числа копий в ДНК тестового образца, который имеет более низкое разрешение. Напротив, массив CGH представляет собой полностью автоматизированный молекулярно-цитогенетический метод анализа вариаций числа копий в ДНК тестового образца, который имеет более высокое разрешение. Таким образом, это суммирует разницу между CGH и массивом CGH.
