Ключевое различие между CRISPR и CRISPR Cas9 заключается в том, что CRISPR (короткие палиндромные повторы с регулярными интервалами) представляет собой природный механизм иммунной защиты прокариот, в то время как CRISPR cas9 представляет собой РНК-управляемую нуклеазу Cas9, которая является частью адаптивного CRISPR. иммунная система.
CRISPR - это иммунная система противовирусной защиты, обнаруженная у бактерий и архей. Это семейство последовательностей ДНК, обнаруженных в бактериальном геноме. Он состоит из спейсерных последовательностей, полученных из фрагментов ДНК бактериофагов, которые ранее их инфицировали. При последующих вирусных инфекциях бактерии используют эти последовательности для разрушения вирусной ДНК. Последовательности CRISPR имеют короткие палиндромные повторы и спейсерные последовательности. Более того, спейсерные последовательности повторов CRISPR часто имеют связанные гены, которые кодируют белки Cas. Cas9 представляет собой РНК-управляемую эндонуклеазу. Вместе с последовательностями CRISPR белок Cas9 действует как адаптивная иммунная система бактерий против бактериофагов.
Что такое CRISPR?
CRISPR означает кластеризованные короткие палиндромные повторы с регулярными интервалами. Это кластер последовательностей ДНК, обнаруженный в бактериальном геноме. Он работает как естественный защитный механизм у бактерий и впервые был обнаружен у кишечной палочки. У бактерий он действует как адаптивная иммунная защита, особенно против бактериофагов. Следовательно, это механизм, зависящий от последовательности.
Рисунок 01: CRISPR
Система CRISPR содержит несколько повторяющихся последовательностей ДНК с короткими сегментами. Эти повторы являются палиндромными, имеют одинаковую последовательность оснований при чтении от 5’ до 3’, в то время как другой дает ту же последовательность при чтении от 3’ до 5’. Более того, повторы идентичны. Они располагаются между короткими «спейсерными» последовательностями ДНК, которые не идентичны. Но эти спейсерные последовательности ДНК аналогичны или совпадают с ДНК чужеродного бактериофага. Гены, связанные с CRISPR, известны как ассоциированные с CRISPR гены или гены Cas. Гены Cas кодируют белки Cas, которые представляют собой хеликазы или нуклеазы. Геликазы раскручивают ДНК, а нуклеазы разрезают ДНК. В целом, при рассмотрении CRISPR, это иммунная система бактерий, которая работает против бактериофагов (бактерий, заражающих вирусы).
Что такое CRISPR Cas9?
Cas9 или CRISPR-ассоциированный белок 9 представляет собой бактериальную РНК-управляемую эндонуклеазу. Следовательно, это фермент, который распознает и разрезает ДНК-мишень (особенно ДНК бактериофага), комплементарную направляющей РНК. Он осуществляет специфическое расщепление нити. Белок Cas9 кодируется геном, ассоциированным с CRISPR. CRISPR cas9 - это управляемая РНК нуклеазная система CRISPR-Cas9, которую можно использовать в качестве РНК-программируемой платформы для нацеливания и редактирования ДНК для редактирования генома, нарушения транскрипции, эпигенетической модуляции и визуализации генома. Эта система CRISPR cas9 очень популярна в современных системах редактирования генома.
Рисунок 02: CRISPR Cas9
В настоящее время система CRISPR/Cas9 используется для изменения или модификации генома млекопитающих путем репрессии или активации транскрипции. Клетки млекопитающих могут реагировать на опосредованные CRISPR/Cas9 разрывы ДНК, применяя механизм репарации. Это можно сделать либо с помощью негомологичного метода соединения концов (NHEJ), либо с помощью направленной по гомологии репарации (HDR). Оба этих механизма репарации реализуются за счет введения двухцепочечных разрывов. Это приводит к редактированию генов млекопитающих. NHEJ может привести к удалению генных мутаций и может быть использован для создания эффектов потери функции. HDR можно использовать для введения определенных точечных мутаций или введения сегментов ДНК различной длины. В настоящее время система CRISPR/Cas используется в терапевтических, биомедицинских, сельскохозяйственных и исследовательских целях.
В чем сходство между CRISPR и CRISPR Cas9?
- Cas9 является частью системы CRISPR Cas.
- Crisper cas9 system - это иммунная система, естественным образом присутствующая в бактериях.
В чем разница между CRISPR и CRISPR Cas9?
CRISPR - это кластер последовательностей ДНК, обнаруженный в бактериальном геноме, который работает как естественная система защиты от бактериофагов. Он состоит из регулярно расположенных коротких палиндромных повторов, спейсеров и ассоциированных генов. Напротив, cas9 представляет собой белок 9, ассоциированный с CRISPR, который представляет собой эндонуклеазный фермент, управляемый РНК. Он распознает и расщепляет двойные цепи ДНК вирусов. По сути, это часть системы защиты CRISPR. Итак, в этом ключевое отличие CRISPR от CRISPR cas9.
Резюме – CRISPR против CRISPR Cas9
CRISPR Cas – система защиты от микробов. CRISPR представляет собой кластер последовательностей ДНК, состоящий из коротких палиндромных повторов, спейсерных последовательностей и ассоциированных генов. Cas9 представляет собой белок Cas, который представляет собой РНК-управляемую эндонуклеазу. CRISPR и белок Cas9 создают иммунную систему, которая работает против бактериофаговых инфекций у бактерий. Белок Cas9 способен расщеплять ДНК чужеродных вирусов и разрушать их. CrRNA направляет cas9 для распознавания вирусной ДНК. Таким образом, система CRISPR cas9 представляет собой естественную иммунную систему бактерий против вирусов. Таким образом, это краткое изложение различий между CRISPR и CRISPR cas9.
