Ключевое различие между экстракцией ДНК растений и животных заключается в том, что при экстракции ДНК растений необходимо разрушить клеточную стенку путем измельчения ткани в сухом льду или жидком азоте, чтобы высвободить клеточное содержимое, в то время как при экстракции ДНК животных, нет необходимости выполнять этот шаг, так как клетки животных не имеют клеточной стенки.
Геномная ДНК – это генетический материал клеток растений и животных. Геномная ДНК уникальна для каждого отдельного растения или животного. Выделение ДНК хорошего качества является необходимым условием для молекулярных исследований. ДНК организмов извлекается для идентификации, диагностики заболеваний, обнаружения определенных генов и последовательностей, судебно-медицинских целей, проверки отцовства, секвенирования генома, разработки лекарств и т. д. Метод выделения ДНК варьируется в зависимости от типа клеток - будь то животная или растительная клетка.
Что такое экстракция ДНК растений?
ДНК из клеток растений выделяют для различных молекулярных исследований. Требуется извлечь неповрежденную, чистую геномную ДНК. Следовательно, существуют различные типы протоколов выделения ДНК, которые отличаются от протоколов выделения ДНК из клеток животных. Это связано с тем, что у растительных клеток есть клеточная стенка, которую необходимо разрушить, чтобы извлечь клеточное содержимое.
Экстракция обычно осуществляется путем измельчения растительных тканей в сухом льду или жидком азоте с использованием ступки и пестика. Затем клеточные мембраны разрушают, а клеточное содержимое выносят в экстракционный буфер. Обычно это делается с помощью моющего средства; Буфер SDS (додецилсульфат натрия) или CTAB (бромид цетилтриметиламмония). Высвобожденную ДНК защищают от эндогенных нуклеаз с помощью хелатирующего агента, такого как ЭДТА. Более того, белки отделяют от ДНК с помощью хлороформа или фенола.
Рисунок 01: Экстракция ДНК растений
Растения синтезируют полисахариды и полифенолы, включая флавоноиды и другие вторичные метаболиты. Эти соединения мешают выделению чистой геномной ДНК. Следовательно, большинство протоколов выделения ДНК растений включают еще один этап, такой как метод градиента плотности хлорида цезия для устранения этих соединений.
Большинство протоколов выделения ДНК рекомендуют использовать образцы свежих листьев для выделения ДНК. Некоторые методы не включают опасные химические вещества, такие как жидкий азот и фенол. Протокол CTAB (бромид цетилтриметиламмония) - это популярный протокол выделения ДНК растений, который облегчает выделение высококачественной геномной ДНК растений. Это простой, безопасный, надежный и экономичный метод выделения ДНК растений. Большинство других методов являются модифицированными версиями метода CTAB.
Что такое выделение ДНК животных?
Извлечение ДНК животных - это извлечение геномной ДНК из клеток животных для молекулярного анализа. В отличие от экстракции ДНК растений, для животных клеток не требуется разрушение клеточной стенки, поскольку у них нет клеточной стенки. Клетки крови являются наиболее распространенным типом клеток животных, которые используются для различных целей.
Рисунок 02: Экстракция ДНК
Фенол-хлороформный метод является одним из лучших вариантов для клеток крови. Выход и качество ДНК высоки при выделении ДНК этим методом. Это протокол жидкостной экстракции ДНК, и этот метод разделяет молекулы ДНК на основе их растворимости в несмешивающихся растворах. Фенол, хлороформ и изоамиловый спирт являются тремя главными ингредиентами этого метода.
Каковы сходства между экстракцией ДНК растений и животных?
- Во время экстракции ДНК растений и животных клеточные мембраны должны быть разрушены.
- ДНК должна быть защищена от эндогенных нуклеаз.
- Кроме того, необходимо предотвратить разрыв ДНК.
- Коммерческие наборы доступны для выделения ДНК растений и ДНК животных.
- Большинство методов выделения ДНК растений и животных нуждаются в постоянной модификации и стандартизации.
В чем разница между экстракцией ДНК растений и животных?
Ключевое различие между экстракцией ДНК растений и животных заключается в том, что экстракция ДНК растений требует измельчения растительной ткани в сухом льду или жидком азоте, чтобы разрушить клеточную стенку, в то время как экстракция ДНК животных не требует этого шага, поскольку они животные. клетки не имеют клеточной стенки. Метод CTAB является одним из лучших методов выделения ДНК растений, а фенол-хлороформный метод - одним из лучших методов выделения ДНК животных.
Ниже в инфографике представлены различия между экстракцией ДНК растений и животных.
Резюме – Экстракция ДНК растений и животных
Для выделения ДНК из разных типов клеток доступны различные методы. Таким образом, протоколы экстракции ДНК растений отличаются от протоколов экстракции ДНК клеток животных. Экстракция ДНК растений требует разрушения клеточной стенки, клеточной мембраны и ядерной мембраны, в то время как экстракция ДНК животных требует разрушения клеточной мембраны и ядерной мембраны. Что еще более важно, экстракция ДНК клеток животных не требует разрушения клеточных стенок путем измельчения в сухом льду или жидком азоте. Таким образом, в этом ключевое различие между экстракцией ДНК растений и животных.