Ключевое различие между внеклеточной ДНК и циркулирующей опухолевой ДНК заключается в том, что бесклеточная ДНК представляет собой различные формы ДНК, которые свободно циркулируют в крови, в то время как циркулирующая опухолевая ДНК представляет собой фрагментированную ДНК, полученную из опухоли, которая циркулирует в крови.
ДНК без клеток и циркулирующая опухолевая ДНК представляют собой два типа циркулирующих нуклеиновых кислот. Циркулирующие нуклеиновые кислоты были открыты Манделем и Металом в 1948 г. Позднее было обнаружено, что количество циркулирующих нуклеиновых кислот у больных значительно выше. Это открытие впервые было сделано в отношении больных волчанкой. Кроме того, циркулирующие нуклеиновые кислоты обладают более высокой прогностической ценностью и могут быть использованы в качестве биомаркера для выявления различных заболеваний.
Что такое бесклеточная ДНК?
Внеклеточная ДНК (Cf ДНК) относится к различным формам ДНК, таким как циркулирующая опухолевая ДНК, внеклеточная митохондриальная ДНК, внеклеточная ДНК плода и т. д., которые свободно циркулируют в крови. Повышенные уровни внеклеточной ДНК наблюдаются при запущенных заболеваниях, таких как рак, травма, сепсис, инфаркт миокарда, диабет, инсульт, серповидно-клеточная анемия и т. д. Помимо рака и фетальной медицины, внеклеточная ДНК является полезным биомаркером для множество недугов. Эта ДНК также может быть использована для обнаружения отторжения трансплантата. Они также используются для определения обычного стресса, пренатального определения пола и тестирования на отцовство.
Рисунок 01: Бесклеточная ДНК
Внеклеточная ДНК обычно представляет собой двухцепочечную внеклеточную молекулу ДНК. Он состоит из небольших фрагментов (от 50 до 200 п.н.) и более крупных фрагментов (21 т.п.н.). Кроме того, он уже признан надежным биомаркером для диагностики рака предстательной железы и молочной железы. Внеклеточная ДНК преимущественно циркулирует в кровотоке в виде нуклеосом. Нуклеосомы представляют собой ядерные комплексы гистонов и ДНК. ДНК Cf можно количественно определить с использованием различных методов, таких как ПЦР, массовое параллельное секвенирование, ультрафиолетовая спектрометрия, окрашивание PicoGreen и ELISA. Поскольку обнаружение ДНК Cf в кровотоке является быстрым, простым, неинвазивным, повторяющимся методом, в будущем он станет потенциальным биомаркером для диагностики многочисленных заболеваний, таких как аутоиммунные ревматические заболевания и опухоли.
Что такое циркулирующая ДНК опухоли?
Циркулирующая опухолевая ДНК (Ct-ДНК) представляет собой фрагментированную ДНК опухоли, которая циркулирует в крови. Имеет опухолевое происхождение. Поскольку циркулирующая опухоль может отражать весь геном опухоли, она получила широкое распространение благодаря своей потенциальной полезности в клинических условиях. Жидкие биопсии, которые берут кровь, могут быть использованы для тестирования циркулирующих опухолей.
Рисунок 02: Циркулирующая ДНК опухоли
Биологические процессы, которые, вероятно, участвуют в высвобождении ДНК Ct, включают апоптоз и некроз из умирающих клеток или активное высвобождение из опухолевых клеток. В здоровых тканях инфильтрирующие фагоциты могут очистить ДНК Ct. Кроме того, для анализа циркулирующей опухолевой ДНК можно использовать различные методы, такие как капельная цифровая ПЦР, BEAMing, CAPP-Seq (глубокое секвенирование), безопасное секвенирование и дуплексное секвенирование..
Каковы сходства между бесклеточной ДНК и циркулирующей ДНК опухоли?
- ДНК вне клеток и циркулирующая опухолевая ДНК представляют собой два типа циркулирующих нуклеиновых кислот.
- Они состоят из нуклеотидов.
- Оба типа могут использоваться в качестве потенциальных маркеров для диагностики различных заболеваний в клинических условиях.
- Они находятся в кровотоке.
- Оба являются внеклеточными формами молекул ДНК.
- Они оба очищаются путем инфильтрации фагоцитами.
В чем разница между бесклеточной ДНК и циркулирующей ДНК опухоли?
Внеклеточная ДНК представляет собой различные формы ДНК, такие как циркулирующая опухолевая ДНК, внеклеточная митохондриальная ДНК и внеклеточная ДНК плода и т. д., которые свободно циркулируют в крови, в то время как циркулирующая опухолевая ДНК представляет собой фрагментированную ДНК, полученную из опухоли что циркулирует в крови. Итак, в этом ключевое различие между бесклеточной ДНК и циркулирующей опухолевой ДНК. Кроме того, внеклеточная ДНК циркулирует фрагментами размером от 50 до 220 п.н., в то время как циркулирующая опухолевая ДНК циркулирует фрагментами размером от 134 до 144 п.н..
Следующая инфографика представляет разницу между бесклеточной ДНК и циркулирующей опухолевой ДНК в табличной форме для параллельного сравнения.
Резюме – Бесклеточная ДНК и циркулирующая опухолевая ДНК
Циркулирующие нуклеиновые кислоты выбрасываются в кровоток посредством регулируемых или случайных механизмов. Внеклеточная ДНК и циркулирующая опухолевая ДНК представляют собой два типа циркулирующих нуклеиновых кислот. Бесклеточная ДНК представляет собой различные формы ДНК, такие как циркулирующая опухолевая ДНК, бесклеточная митохондриальная ДНК, бесклеточная ДНК плода, которые свободно циркулируют в крови, в то время как циркулирующая опухолевая ДНК представляет собой фрагментированную ДНК, полученную из опухоли, которая циркулирует в крови. Таким образом, это суммирует разницу между внеклеточной ДНК и циркулирующей опухолевой ДНК.
