Ключевое различие между тиоцианатом гуанидина и гидрохлоридом гуанидина заключается в том, что тиоцианат гуанидина является более сильным денатурантом белка, который чаще используется при выделении РНК, тогда как гидрохлорид гуанидина является более слабым денатурантом белка, который реже используется при выделении РНК.
Денатурация - это процесс, при котором белки теряют свою четвертичную структуру, третичную структуру и вторичную структуру, которая обычно присутствует в их нативном состоянии. Это может быть сделано путем применения некоторого внешнего стресса или соединений, таких как сильная кислота или основание, концентрированная неорганическая соль, органический растворитель (спирт, хлороформ), перемешивание, облучение или нагревание. Тиоцианат гуанидина и гидрохлорид гуанидина представляют собой два разных типа денатурантов белка.
Что такое тиоцианат гуанидина?
Тиоцианат гуанидина (GTC) - более сильный денатурирующий белок агент, который чаще используется при выделении РНК. Он также известен как изотиоцианат гуанидиния (GITC). Будучи хаотропным агентом, это химическое соединение обычно используется в качестве общего денатуранта белка. Хаотропный агент - это молекула в водном растворе, которая может разрушить сеть водородных связей между молекулами воды. Это влияет на стабильность нативного состояния других молекул в растворе, таких как макромолекулы, такие как белки и нуклеиновые кислоты, за счет ослабления гидрофобного эффекта. Хаотропные агенты, такие как тиоцианат гуанидина, снижают порядок в структуре белка, образованного молекулами воды как в объеме, так и в гидратных оболочках вокруг гидрофобных аминокислот. Это может вызвать денатурацию белка.
Тиоцианат гуанидина можно использовать для деактивации вирусов, таких как грипп, которые вызывают такие заболевания, как испанский грипп в 1918 году. Поэтому его можно использовать в медицинских или больничных учреждениях. Кроме того, тиоцианат гуанидина также используется для лизиса клеток и вирусных частиц при экстракции РНК и ДНК. Здесь функция тиоцианата гуанидина заключается в содействии лизирующему действию и предотвращении активности ферментов РНКаз и ферментов ДНКаз путем денатурации. В противном случае эти ферменты могут повредить экстракт (РНК или ДНК).
Что такое гидрохлорид гуанидина?
Гуанидина гидрохлорид (GdnHCl) представляет собой более слабый денатурант белка, который реже используется при выделении РНК. Он также известен как хлорид гуанидиния (GdmCl). Это гидрохлоридная соль гуанидина. Гидрохлорид гуанидина хаотропен и является одним из денатурантов, используемых в физико-химических исследованиях фолдинга белков.
Рисунок 01: Гидрохлорид гуанидина
Гуанидина гидрохлорид также обладает способностью снижать активность ферментов и повышать растворимость гидрофобных молекул. Обычно при более высоких концентрациях гидрохлорида гуанидина белки теряют свою упорядоченную структуру. При этой концентрации гидрохлорида гуанидина белки имеют тенденцию беспорядочно скручиваться. В медицинских или больничных учреждениях гидрохлорид гуанидина показан для уменьшения симптомов мышечной слабости и легкой утомляемости, связанных с синдромом Итона-Ламберта. Кроме того, побочные эффекты использования гидрохлорида гуанидина могут включать перистальтику, диарею и фатальное угнетение костного мозга.
Каковы сходства между тиоцианатом гуанидина и гидрохлоридом гуанидина?
- Тиоцианат гуанидина и гидрохлорид гуанидина представляют собой два разных типа денатурантов белка.
- Оба денатуранта имеют в своей структуре гуанидин.
- Они являются хаотропными агентами.
- Для выделения РНК можно использовать оба денатуранта.
- Они оба используются в медицинских учреждениях или больницах.
В чем разница между тиоцианатом гуанидина и гидрохлоридом гуанидина?
Тиоцианат гуанидина является более сильным денатурантом белка, который чаще используется при выделении РНК, в то время как гидрохлорид гуанидина является более слабым денатурантом белка, который реже используется при выделении РНК. Таким образом, в этом ключевое различие между тиоцианатом гуанидина и гидрохлоридом гуанидина. Кроме того, химическая формула тиоцианата гуанидина имеет вид C2H6N4S, а химическая формула гидрохлорида гуанидина: CH5N3HCl.
Приведенная ниже инфографика представляет различия между тиоцианатом гуанидина и гидрохлоридом гуанидина в табличной форме для параллельного сравнения.
Резюме – Тиоцианат гуанидина против гидрохлорида гуанидина
Тиоцианат гуанидина и гидрохлорид гуанидина представляют собой два разных типа денатурантов белка. Оба денатуранта являются хаотропами. Тиоцианат гуанидина является более сильным денатурантом белка, который чаще используется при выделении РНК, в то время как гидрохлорид гуанидина является более слабым денатурантом белка, который реже используется при выделении РНК. Итак, это резюмирует разницу между тиоцианатом гуанидина и гидрохлоридом гуанидина.
