Ключевая разница - VNTR против STR
Исследования ДНК имеют огромное значение для понимания и определения филогенетических отношений, диагностики генетических заболеваний и картирования геномов организмов. Несколько методов, связанных с анализом ДНК, используются для идентификации определенного гена или последовательности ДНК в пуле неизвестной ДНК. Они известны как генетические маркеры. Генетические маркеры используются в молекулярной биологии для выявления генетических различий между особями и видами. Тандемный повтор с переменным числом повторов (VNTR) и короткий тандемный повтор (STR) представляют собой два типа генетических маркеров, которые демонстрируют полиморфизм среди людей. Оба типа представляют собой некодирующие повторяющиеся ДНК, которые представляют собой тандемные повторы. Они расположены в хромосомах по принципу «голова к хвосту». VNTR - это участок генома, в котором короткая последовательность нуклеотидов повторяется несколько раз. STR - это еще один участок ДНК в геноме, организованный в виде повторяющихся единиц, состоящих из двух-тринадцати нуклеотидов в сто раз. Ключевое различие между VNTR и STR заключается в количестве нуклеотидов в повторяющейся последовательности. Повторяющиеся единицы VNTR состоят из 10–100 нуклеотидов, а повторяющиеся единицы STR состоят из 2–13 нуклеотидов. VNTR и STR широко используются в криминалистических исследованиях.
Что такое ВНТР?
Тандемный повтор представляет собой короткую последовательность ДНК, которая повторяется от головы к хвосту в определенном хромосомном локусе. В тандемном повторе нет другой последовательности или нуклеотида. В геноме есть несколько типов тандемных повторов. Среди них VNTR представляет собой тип тандемного повтора, который имеет повторяющиеся единицы, состоящие из 10–100 нуклеотидов. ВНТР - это тип миниспутника. Эти тандемные повторы можно найти во многих хромосомах. Они рассеяны в геноме человека и расположены преимущественно в субтеломерных областях хромосом.
VNTR демонстрируют полиморфизм тандемных повторов среди людей. Длина VNTR в определенном месте хромосомы сильно различается у разных людей из-за различий в количестве повторяющихся единиц, организованных в этом участке ДНК. Таким образом, VNTR можно использовать в качестве мощного инструмента для идентификации людей, а анализ VNTR используется во многих областях, включая генетику, биологические исследования, судебную экспертизу и дактилоскопию ДНК. VNTR были первыми генетическими маркерами, используемыми для количественной оценки приживления трансплантата костного мозга. VNTR также были первыми полиморфными маркерами, используемыми для профилирования ДНК в криминалистике.
Рисунок 01: Варианты VNTR у шести человек
Анализ VNTR проводят с помощью полиморфизма длин рестрикционных фрагментов с последующей Саузерн-гибридизацией. Следовательно, для этого нужен сравнительно большой образец ДНК. Интерпретация профиля VNTR также проблематична. Из-за этих ограничений использование VNTR в судебно-медицинской генетике было ограничено, и он был заменен анализом STR.
Что такое STR?
STR - это сильно повторяющийся участок ДНК, состоящий из двух-тринадцати повторяющихся единиц нуклеотидов, организованных тандемным образом. STR похож на VNTR. Но он варьируется от VNTR от количества нуклеотидов в повторяющейся последовательности и количества повторов. STR - тип микроспутника.
STR анализ, связанный с измерением точного количества повторяющихся единиц. STR сильно различаются среди людей, как и VNT. Профили STR отличаются от человека к человеку. Поэтому STR-анализ используется в молекулярной биологии для сравнения конкретных локусов ДНК из двух или более образцов. Следовательно, STR считаются мощными генетическими маркерами в молекулярной биологии. Он обеспечивает превосходный инструмент для идентификации особей из-за их высокой степени полиморфизма и относительно небольшой длины.
В настоящее время STR являются наиболее часто используемым инструментом анализа генетического полиморфизма в судебно-медицинской генетике. Большинство судебно-медицинских экспертиз включают полиморфный анализ STR. Локусы STR распространены по всему геному. В хромосомах расположены тысячи STR, которые можно использовать в криминалистическом анализе. Анализ STR не включает полиморфизм длины рестрикции, как анализ VNTR. STR-анализ не разрезает ДНК рестрикционными ферментами. Специфические зонды используются для присоединения нужных участков к ДНК, и с помощью метода ПЦР определяются длины STR.
Рисунок 02: Изменение STR между образцами
В чем сходство между VNTR и STR?
- VNTR и STR представляют собой некодирующие ДНК.
- Оба являются тандемными повторами.
- Оба демонстрируют полиморфизм среди людей из-за разницы в длине участка ДНК.
- Оба используются в качестве мощных генетических маркеров в дактилоскопии ДНК и в судебно-медицинских исследованиях.
В чем разница между VNTR и STR?
VNTR против STR |
|
| VNTR представляет собой некодирующую повторяющуюся ДНК, которая имеет короткую последовательность нуклеотидов, повторяющуюся тандемным образом. | STR - это сильно повторяющийся участок ДНК, состоящий из двух-тринадцати повторяющихся нуклеотидных единиц, организованных тандемным образом. |
| Размер | |
| VNTR больше, чем STR. | STR меньше, чем VNTR. |
| Количество нуклеотидов в повторяющейся последовательности | |
| Повторяющаяся единица VNTR состоит из 10–100 нуклеотидов. | Повторяющаяся единица STR состоит из 2–13 нуклеотидов. |
Резюме – VNTR против STR
VNTR и STR - два мощных генетических маркера, используемых в молекулярной биологии, особенно в области судебной генетики. VNTR - это тип миниспутника, а STR - это микроспутник. VNTR и STR представляют собой некодирующие ДНК с высокой повторяемостью. Это тандемные повторы. Общая структура VNTR и STR одинакова. Однако количество нуклеотидов в повторяющейся последовательности и ее длина различны. VNTR имеет повторяющиеся последовательности, состоящие из 10–100 нуклеотидов. STR имеет повторяющиеся последовательности, состоящие из 2-13 нуклеотидов. В этом разница между VNTR и STR.
Загрузить PDF-версию VNTR vs STR
Вы можете загрузить PDF-версию этой статьи и использовать ее в автономном режиме в соответствии с примечаниями к цитированию. Пожалуйста, загрузите PDF-версию здесь. Разница между VNTR и STR.
