Основное различие между Cosmid и Phagemid заключается в типе содержащихся в нем последовательностей. Космида содержит сайт cos и плазмиду. Таким образом, это гибридный вектор, тогда как Phagemid представляет собой плазмиду, содержащую начало репликации F1 фага F1.
Космиды и Фагемиды используются для целей клонирования, особенно для клонирования более крупных фрагментов ДНК. Они широко используются, особенно при клонировании генов, ответственных за производство различных белков. Космиды и фагемиды либо реплицируются отдельно в виде плазмид, либо упаковываются в вирусные частицы и затем реплицируются.
Что такое Космида?
Космида, называемая гибридной плазмидой, содержит сайты cos, экстрагированные из частиц фага Lambda, и плазмиду. Эти cos-сайты представляют собой длинные фрагменты ДНК с 200 парами оснований. Следовательно, они имеют когезивные или липкие концы, которые позволяют плазмиде вписываться в вирусную ДНК. Следовательно, сайты cos жизненно важны для упаковки ДНК.
Есть три сайта cos;
- сайт cosN – участвует в разрыве нити ДНК под действием терминазы
- Сайт cosB – занимается проведением терминазы.
- сайт cosQ – участвует в предотвращении деградации ДНК ДНКазами.
Рисунок 01: Космида
Кроме того, космиды могут реплицировать либо одноцепочечную ДНК, либо двухцепочечную ДНК, используя подходящее начало репликации. Космиды обычно содержат гены устойчивости к антибиотикам в качестве маркеров для селекции трансформантов. Таким образом, использование космиды в качестве вектора может облегчить клонирование, а расщепление вектора рестрикционными ферментами может затем извлечь эти фрагменты.
Что такое Phagemid (Фасмид)?
Phagemid, также называемый Phasmid, также является типом гибридного вектора. Фагемида содержит особый ориджин репликации, называемый ориджином репликации f1. Источник репликации f1 извлечен из фага f1.
Фагемида может реплицировать как одноцепочечную, так и двухцепочечную ДНК. Репликация может происходить либо как плазмида, подвергаясь независимой репликации, либо может быть упакована в фаговые частицы и, наконец, заразить бактерию-хозяина E coli. При заражении клеток кишечной палочки фаг f1 требует наличия ворсинок. Следовательно, половые пили важны при упаковке фагемид in vitro.
Каковы сходства между Космидой и Фагемидой?
- И Cosmid, и Phagemid являются клонирующими векторами, используемыми в технологии рекомбинантной ДНК.
- Космида и Фагемида могут реплицировать одноцепочечную и двухцепочечную ДНК.
- Оба могут подвергаться независимой репликации подобно плазмидам.
- Космид и Фагемид могут подвергаться упаковке in vitro и инфицировать бактериальные клетки.
- И Cosmid, и Phagemid требуют подходящего начала репликации для клонирования.
В чем разница между космидой и фагемидой?
Космид против Фагемида |
|
| Космида представляет собой гибридный вектор, содержащий сайт cos и плазмиду. | Phagemid представляет собой плазмиду, содержащую точку начала репликации F1 фага F1. |
| Наличие сайтов Cos | |
| Cos-сайты присутствуют в космиде и необходимы для упаковки in vitro. | Cos-сайты отсутствуют в фагемидах. |
| Наличие источника репликации F1 | |
| В космиде точка начала репликации может присутствовать или не присутствовать. | Ориджин репликации F1 присутствует в фагемиде. |
| Наличие генов устойчивости к антибиотикам | |
| Гены устойчивости к антибиотикам присутствуют в космидах для идентификации трансформантов от нетрансформантов. | У фагемид отсутствуют гены устойчивости к антибиотикам. |
| Требования к упаковке in vitro | |
| Требуется сайт cos. | Требуется половой пилус. |
Резюме – Космид против Фагемида
Cosmid и Phagemid являются клонирующими векторами, используемыми в технологии рекомбинантной ДНК. Космиды представляют собой гибридные векторы, которые содержат специальные липкие концы, известные как сайты cos. Для упаковки in-vitro требуются эти сайты cos. В то время как фагемиды представляют собой плазмиды, которые содержат точку начала репликации f1, извлеченную из фага f1. И космида, и фагемида могут подвергаться независимой репликации или упаковке in vitro в бактериальные клетки. Таковы важные различия между космидой и фагемидой.
