Ключевое различие между консенсусной ПЦР и пан-ПЦР заключается в том, что консенсус-ПЦР всегда нацелен на консервативные области, тогда как пан-ПЦР нацелен на вариабельные области для идентификации различных штаммов группы
Полимеразная цепная реакция (ПЦР) представляет собой метод амплификации генов, который состоит из трех основных этапов: денатурации, отжига и удлинения. Это широко используется в диагностике и молекулярной идентификации. Методы консенсусной ПЦР и Пан-ПЦР основаны на праймерах-мишенях, которые использует каждый тип ПЦР.
Что такое консенсус PCR?
Консенсус-ПЦР - это метод ПЦР, нацеленный на консервативную область для определенного вида или рода. Поэтому для амплификации выбирают высококонсервативные участки. С помощью этого метода организмы можно идентифицировать и различать на основе их консенсуса. Этот метод определяет охраняемый регион для определенного вида. Например, область 16s рРНК бактерий остается консервативной областью среди бактерий. Поэтому для амплификации требуется только один набор праймеров. В большинстве случаев для консервативной области можно использовать универсальный праймер.
Рисунок 01: Техника ПЦР
Следуя консенсусному методу ПЦР, можно вывести характеристики видов и эволюционные отношения. Основываясь на эффективности амплификации конкретного образца организма, также можно сделать вывод о консенсусе организма по отношению к группе. Кроме того, проведение консенсусной ПЦР имеет жизненно важное значение в филогенетических исследованиях. Это позволяет идентифицировать вид и интерпретировать отклонение конкретного организма с точки зрения общего предка.
Что такое Pan PCR?
A Pan PCR - это режим мультиплексирования PCR. В этом методе различные штаммы амплифицируются с использованием различных праймеров-мишеней. Однако мишени могут быть общими мишенями для групп штаммов. Таким образом, в Пан-ПЦР одновременно можно использовать более двух наборов праймеров. Это может иметь место в методе реакции в одной пробирке или в методе реакции в нескольких трубках. Пан-ПЦР требует больше времени и является более сложным по сравнению с консенсусной ПЦР. По этой причине интерпретация результатов ПЦР также может быть более сложной в Пан-ПЦР.
Пан-ПЦР в основном применяется в молекулярной диагностике. Это позволяет различать разные штаммы одного вида путем целевой амплификации. Пан-ПЦР - идеальный метод для выявления различных штаммов одного вида, вызывающих заболевание. В большинстве случаев автоматизация методов Pan PCR для различных состояний здоровья очень важна и является надежным и высокоэффективным методом.
Каковы сходства между консенсусной PCR и Pan PCR?
- Консенсус-ПЦР и Пан-ПЦР - это два типа методов ПЦР.
- Обе процедуры следуют общей трехэтапной процедуре – денатурация, отжиг и удлинение.
- Они используют специальные праймеры.
- Обе реакции происходят в термоциклере.
- Эти реакции можно автоматизировать.
- Оба могут быть использованы в молекулярной диагностике и идентификации; однако точность варьируется.
- Эти процедуры требуют проверки.
В чем разница между консенсусной PCR и Pan PCR?
И Consensus, и Pan PCR следуют одной и той же стандартной процедуре. Однако ключевое различие между ПЦР консенсуса и ПЦР Pan основано на праймерах-мишенях, используемых в каждой процедуре. В то время как консенсусная ПЦР всегда нацелена на консервативные области, Пан-ПЦР нацелена на вариабельные области для идентификации различных штаммов группы. Из-за этой разницы протоколы разработки праймеров, количество используемых наборов праймеров и конкретные приложения различаются.
Приведенная ниже инфографика обобщает разницу между консенсусным PCR и Pan PCR.
Резюме – Консенсус PCR против Pan PCR
ПЦР, представленная Мулли, играет важную революционную роль в приложениях молекулярной биологии. Консенсус и пан-ПЦР представляют собой два типа ПЦР, основанные на их областях-мишенях для праймеров. В то время как консенсусная ПЦР нацелена на консервативные области, Пан-ПЦР нацелена на вариабельные области и играет важную роль в идентификации штаммов. Из-за этого основного различия между консенсусной ПЦР и Пан-ПЦР конкретные функции каждого типа ПЦР также варьируются от филогенетического анализа до молекулярной характеристики и молекулярной диагностики.
