Ключевое различие между PARP1 и PARP2 заключается в том, что растительный и животный PARP1 несут мотивы связывания ДНК Zn-finger, в то время как растительный PARP2 несет N-концевые мотивы связывания ДНК SAP.
Поли-АДФ-рибозополимераза (PARP) представляет собой семейство белков, являющихся ядерными ферментами. В семейство PARP входит 17 различных типов ферментов PARP. PARP1 и PARP2 - два фермента, необходимых для нормального восстановления ДНК.
Что такое PARP?
PARP (поли-АДФ-рибозополимераза) - это семейство белков, которые участвуют во многих клеточных процессах, таких как репарация ДНК, стабильность генома и запрограммированная гибель клеток. Они катализируют процесс, называемый АДФ-рибозилированием. АДФ-рибозилирование относится к добавлению звеньев АДФ-рибозы из никотинамидадениндинуклеотида (НАД) к субстратам-мишеням для восстановления разрывов нитей ДНК.
Ферменты
PARP представляют собой ДНК-связывающие белки. Они активируются разрывами, присутствующими в молекулах ДНК. Как только они связываются с разрывами ДНК, они гидролизуют NAD+ в никотинамид и способствуют полимеризации АДФ-рибозы. Следовательно, ядерные ферменты PARP участвуют в репарации ДНК. Более того, поли-АДФ-рибозилирование работает как посттрансляционная модификация, играющая ключевую роль в репликации, регуляции транскрипции, поддержании теломер и деградации белка. Ферменты PARP также участвуют в поддержании стабильности генома, регуляции структуры хроматина, пролиферации клеток и апоптозе.
Что такое PARP1?
PARP1 является членом семейства белков PARP. Это первый и лучше всего охарактеризованный белок в этом семействе. Он действует как первый ответчик, который обнаруживает повреждения ДНК, а затем облегчает выбор механизма восстановления. Кроме того, PARP1 регулирует репарацию повреждений одноцепочечной ДНК.
Рисунок 01: PARP1
В дополнение к восстановлению одноцепочечных разрывов ДНК, PARP1 регулирует прогрессирование и перезапуск вилки репликации. Кроме того, он способствует альтернативному негомологичному соединению концов.
Что такое PARP2?
PARP2 является еще одним членом семейства белков PARP. Он тесно связан с ферментом PARP1. Ген PARP2 кодирует белок PARP2 у человека. PARP2 имеет каталитический домен, но не имеет N-концевого ДНК-связывающего домена. Противораковые препараты-ингибиторы PARP могут ингибировать PARP2, подобно PARP1.
Рисунок 02: PARP2
У растений, особенно у Arabidopsis thaliana, PARP2 играет более важную роль в защитных реакциях на повреждение ДНК и бактериальном патогенезе, чем PARP1.
Каковы сходства между PARP1 и PARP2?
- PARP1 и PARP2 представляют собой два типа ядерных ферментов.
- Они используют NAD+ в качестве субстрата для катализа рибозилирования поли-АДФ.
- Оба активируются одноцепочечными разрывами ДНК.
- PARP1 и PARP2 млекопитающих расположены в ядре.
- И PARP1, и PARP2 взаимодействуют с хроматином.
- Они восстанавливают повреждения ДНК.
- Некоторые противораковые препараты-ингибиторы PARP, нацеленные на PARP1, также ингибируют PARP2.
В чем разница между PARP1 и PARP2?
PARP1 является членом семейства белков PARP, которое имеет каталитический домен и N-концевой ДНК-связывающий домен, в то время как PARP2 является членом семейства PARP, в котором отсутствует N-концевой ДНК-связывающий домен. Ключевое различие между PARP1 и PARP2 заключается в том, что растительный и животный PARP1 несут мотивы связывания ДНК Zn-finger, в то время как растительный PARP2 несет N-концевые мотивы связывания ДНК SAP.
Следующая инфографика суммирует разницу между PARP1 и PARP2.
Резюме – PARP1 против PARP2
PARP - это ядерные ферменты, которые обнаруживают повреждения ДНК и восстанавливают их. PARP1 и PARP2 - два из них, которые тесно связаны между собой. Оба фермента имеют каталитический домен. Но в PARP2 отсутствует N-концевой ДНК-связывающий домен, который присутствует в PARP1. Таким образом, это ключевое различие между PARP1 и PARP2. Оба типа ферментов используют НАД+ в качестве своего субстрата.