Основное различие между фикоцианином и аллофикоцианином заключается в том, что фикоцианин поглощает и излучает на более коротких длинах волн, чем аллофикоцианин.
Фикобилипротеины - это семейство водорастворимых белков, присутствующих в цианобактериях и некоторых видах водорослей. Фикоцианин и аллофикоцианин являются двумя основными членами этого семейства.
Что такое фикоцианин?
Фикоцианин представляет собой пигментно-белковый комплекс из семейства светособирающих фикобилипротеинов. Другими важными членами этого семейства являются аллофикоцианин и фикоэритрин. Этот пигмент является вспомогательным пигментом хлорофилла. Как правило, все фикобилипротеины представляют собой водорастворимые комплексы, которые не могут существовать внутри мембран, подобно каротиноидам. Вместо того, чтобы существовать в мембранах, эти пигменты склонны агрегировать, образуя кластеры, которые могут прикрепляться к мембранам, известные как фикобилисомы..
Рисунок 01: Экстрагированные фикоцианиновые пигменты (из цианобактерий)
Мы можем наблюдать, что фикоцианин имеет характерный светло-голубой цвет, который может поглощать оранжевый и красный свет (около 620 нм) и может излучать флуоресценцию (около 650 нм). Мы можем найти этот цветовой пигмент у цианобактерий, а название «фикоцианин» происходит от греческого значения «Phyco», которое относится к «водорослям», и суффикса «цианин» от греческого значения «Kyanos», что означает «темно-синий».
Как правило, молекулы фикоцианина имеют общую структуру со всеми фикобилипротеинами. При рассмотрении структуры этого пигмента она начинается со сборки мономеров фикобилипротеинов. Эти мономеры представляют собой гетеродимеры, состоящие из альфа- и бета-субъединиц с соответствующими хромофорами. Хромофоры и субъединицы соединены тиоэфирной химической связью.
Субъединицы структуры фикоцианина обычно содержат восемь альфа-спиралей. Мономерные структуры склонны спонтанно агрегировать, образуя кольцеобразные тримеры, обладающие вращательной симметрией и центральным каналом. Более того, тримеры склонны агрегировать попарно, образуя гексамеры, которым помогают дополнительные линкерные белки. Следовательно, каждая фикобилисомная палочка содержит два или более гексамеров фикоцианина.
Что такое аллофикоцианин?
Аллофикоцианин - это белковая молекула из семейства фикобилипротеинов, являющаяся вспомогательным пигментом хлорофилла. Другие члены этого светособирающего семейства фикобилипротеинов включают фикоцианин, фикоэритрин и фикоэритроцианин. Аллофикоцианиновые пигменты могут поглощать и излучать красный свет, и мы можем легко найти этот пигмент в цианобактериях и красных водорослях.
Рисунок 02: Внешний вид аллофикоцианина на диаграмме
Мы можем выделить аллофикоцианин из различных видов красных или сине-зеленых водорослей. Эти водоросли производят немного разные формы молекулы. Как правило, молекула аллофикоцианина содержит две разные субъединицы, называемые альфа- и бета-субъединицей. Каждая субъединица имеет один хромофор фикоцианобилина.
Есть различные области применения аллофикоцианина; многие инструменты были разработаны специально для аллофикоцианина. Например, этот компонент обычно используется в иммуноанализах, включая FACS, проточную цитометрию и т. д.
Каковы сходства между фикоцианином и аллофикоцианином?
- Фикоцианин и аллофикоцианин являются водорастворимыми белками
- Оба входят в семейство фикобилипротеинов.
В чем разница между фикоцианином и аллофикоцианином?
Фикобилипротеины - это семейство водорастворимых белков, присутствующих в цианобактериях и некоторых видах водорослей. Фикоцианин и аллофикоцианин являются двумя основными членами этого семейства. Ключевое различие между фикоцианином и аллофикоцианином заключается в том, что фикоцианин поглощает и излучает на более коротких волнах, чем аллофикоцианин.
Ниже в инфографике перечислены дополнительные различия между фикоцианином и аллофикоцианином в табличной форме для параллельного сравнения.
Резюме – фикоцианин против аллофикоцианина
Фикобилипротеины - это семейство водорастворимых белков, присутствующих в цианобактериях и некоторых видах водорослей. Фикоцианин и аллофикоцианин являются двумя основными членами этого семейства. Ключевое различие между фикоцианином и аллофикоцианином заключается в том, что фикоцианин поглощает и излучает на более коротких длинах волн, чем аллофикоцианин.