Ключевое различие между составными транспозонами и элементами IS заключается в том, что составные транспозоны представляют собой тип транспозонов, которые несут дополнительные гены, такие как гены устойчивости к антибиотикам, в то время как элементы IS (или элементы последовательности вставки) являются мобильными элементами, которые несут только те гены, которые кодируют транспозазы, которые катализируют транспозиционную активность.
Транспозон - это фрагмент ДНК, который может менять свое положение в бактериальном геноме. Следовательно, они являются мобильными последовательностями ДНК. Они перемещаются в новые участки генома, внося изменения в последовательность бактериального генома, вызывая значительные изменения в генетической информации. Транспозоны также известны как прыгающие гены, поскольку они могут блокировать транскрипцию генов и перестраивать генетический материал бактерии. Более того, они ответственны за перемещение генов лекарственной устойчивости, устойчивости к антибиотикам между плазмидами и хромосомами. Составные транспозоны и элементы IS представляют собой два типа мобильных генетических элементов, обнаруженных у бактерий. Оба могут перемещаться из одного места в другое в геноме.
Что такое составные транспозоны?
Композитный транспозон представляет собой сегмент ДНК, окруженный двумя копиями одинаковых вставочных элементов последовательности. В составном транспозоне есть центральная белок-кодирующая область. Гены часто являются генами устойчивости к антибиотикам. Они также могут содержать катаболические гены. Более того, составной транспозон состоит из двух инвертированных повторов. Вся длина составного транспозона движется как единое целое.
Рисунок 01: Композитный транспозон
Tn10 - составной транспозон. Он состоит из центральной кодирующей области размером 6,5 т.п.н. (ген устойчивости к тетрациклину) и 1,4 т.п.о. инвертированных элементов последовательности вставки на каждом конце. IS элементы снабжают транспозазой. Транспозаза - фермент, катализирующий движение транспозона. Составные транспозоны можно амплифицировать, создавая праймеры для IS-элементов.
Что такое элементы IS?
Элементы последовательности вставки или элементы IS представляют собой тип мобильного генетического элемента. Они представляют собой простую форму транспозонов. Они несут только гены, кодирующие ферменты транспозазы. Ферменты транспозазы катализируют транспозицию транспозонов. Структурно кодирующая последовательность IS-элементов окружена двумя инвертированными повторами. Например, элемент IS, называемый IS911, окружен двумя перевернутыми концами повтора по 36 пар оснований.
IS элементы являются наиболее распространенными автономными мобильными элементами в бактериальном геноме. Следовательно, они чрезвычайно важны для организации и эволюции прокариотического генома. Более того, IS-элементы встречаются как части составных транспозонов. Как правило, два элемента IS находятся по бокам от кодирующей последовательности составного транспозона. Но единичные транспозоны не несут фланкирующих IS-элементов.
Поскольку элементы IS могут перемещаться внутри генома, они могут прерывать кодирующую последовательность других генов и инактивировать гены, блокируя экспрессию.
Каковы сходства между составными транспозонами и элементами IS?
- И составные транспозоны, и IS-элементы способны менять положение в бактериальном геноме.
- Кодирующая область в обоих транспозонах обычно окружена инвертированными повторами.
- Композитный транспозон окружен двумя отдельными элементами IS.
В чем разница между составными транспозонами и элементами IS?
Композитные транспозоны представляют собой мобильные генетические элементы, состоящие из двух инсерционных последовательностей (ИС), часто фланкирующих один или несколько генов устойчивости к антибиотикам. С другой стороны, IS-элементы представляют собой тип простого мобильного элемента, который содержит гены, кодирующие фермент транспозазу, катализирующий транспозицию. Итак, в этом ключевое отличие составных транспозонов от IS-элементов.
Ниже приведен список различий между составными транспозонами и элементами IS в табличной форме для параллельного сравнения.
Резюме – Составные транспозоны против IS-элементов
Геном бактерий имеет мобильные генетические элементы. Составные транспозоны и IS-элементы представляют собой два типа мобильных генетических элементов. Составные транспозоны несут гены устойчивости к антибиотикам и фланкирующие элементы IS. IS-элементы несут генетический код для производства транспозазы, которая катализирует движение транспозонов. Таким образом, в этом ключевое отличие составных транспозонов от ИС-элементов.
