Ключевое различие между последовательностями Шайна Далгарно и Козака заключается в том, что последовательность Шайна Далгарно является сайтом связывания рибосом в матричной РНК бактерий и архей, тогда как последовательность Козака является сайтом инициации трансляции белка в большинстве матричных РНК эукариот.
Последовательности Shine Dalgarno и Kozak представляют собой две согласованные последовательности, которые очень важны для инициации трансляции. В молекулярной биологии трансляция - это процесс, посредством которого рибосомы в цитоплазме синтезируют белки после процесса транскрипции. При трансляции мРНК (информационная РНК) расшифровывается на рибосоме с образованием специфической цепи аминокислот вне ядра. Как правило, рибосома индуцирует процесс декодирования, облегчая связывание комплементарных последовательностей антикодонов тРНК с кодонами мРНК. Трансляция протекает в три этапа: инициация, элонгация и терминация.
Что такое последовательность Шайна Далгарно?
Последовательность Shine Dalgarno представляет собой сайт связывания рибосом в матричной РНК бактерий и архей. Обычно он расположен примерно на 8 оснований выше стартового кодона AUG. Эта последовательность РНК помогает привлекать рибосомы к матричной РНК, выравнивая рибосому со стартовым кодоном мРНК. Таким образом, он инициирует синтез белка. После рекрутирования тРНК может добавлять аминокислоты в последовательности, определяемой кодонами мРНК. Эта особая последовательность характерна для бактерий, но реже для архей. Кроме того, он также присутствует в хлоропластах и митохондриальных транскриптах. Последовательность Шайна Далгарно была впервые предложена австралийскими учеными Джоном Шайном и Линн Далгарно. Консенсусная последовательность из шести оснований представляет собой AGGAGG. Например, в Escherichia coli последовательность AGGAGGU.
Рисунок 01: Последовательность Шайна Далгарно
Выбор сайта инициации (AUG) зависит от взаимодействия между 30S субъединицей рибосомы и матрицей мРНК. Богатая пиримидином область компонента 16srРНК субъединицы 30S связывается с богатой пуринами областью, известной как последовательность Шайна Далгарно, выше инициирующего кодона AUG в мРНК. Кроме того, во время образования комплекса инициации эти комплементарные последовательности нуклеотидов соединяются, образуя двухцепочечную структуру РНК. Это облегчает связывание мРНК с рибосомой таким образом, что инициирующий кодон располагается в P-сайте рибосомы.
Что такое последовательность Козака?
Последовательность Козака является сайтом инициации трансляции белка в большинстве эукариотических мРНК. Эта последовательность также называется консенсусной последовательностью Козака. Последовательность Козака является оптимальной последовательностью для инициации трансляции у эукариот. Эта последовательность является неотъемлемым аспектом регуляции белка. Это также очень важно для общего клеточного здоровья. Он помогает корректировать перевод белков из генетических сообщений, опосредуя сборку рибосом и инициацию трансляции.
Рисунок 02: Последовательность Козака
Эта последовательность была названа в честь ученого, открывшего ее, Мэрилин Козак. Она обнаружила это путем детального анализа геномных последовательностей ДНК. Последовательность Козака - 5’ (gcc) gccRccAUGG-3’. Буквы верхнего регистра обозначают сохраняющиеся основания, а буквы нижнего регистра обозначают общие переменные основания. R указывает на пурин (аденин или гуанин), который всегда находится в этом месте.
Каковы сходства между Shine Dalgarno и Kozak Sequence?
- Последовательности Шайна Далгарно и Козака - это две согласованные последовательности, которые очень важны для инициации трансляции.
- Оба являются последовательностями РНК.
- Меньшая субъединица рибосомы связывается с обеими последовательностями.
- Обе последовательности обеспечивают правильную сборку рибосомы и инициацию трансляции.
- Они являются неотъемлемыми аспектами регуляции белка и общего состояния клеток.
В чем разница между Shine Dalgarno и Kozak Sequence?
Последовательность Shine Dalgarno представляет собой сайт связывания рибосом, обнаруженный в матричной РНК бактерий и архей, а последовательность Kozak представляет собой сайт инициации трансляции белка, обнаруженный в большинстве эукариотических матричных РНК. Итак, в этом ключевое отличие между последовательностью Шайна Далгарно и Козака. Кроме того, последовательность Шайна Далгарно представляет собой 5’AGGAGGU3’, а последовательность Козака представляет собой 5’ (gcc) gccRccAUGG-3’.
В следующей инфографике перечислены различия между последовательностями Shine Dalgarno и Kozak в табличной форме для параллельного сравнения.
Резюме – Последовательность Шайн Далгарно против Козака
Shine Последовательности Далгарно и Козака представляют собой две консенсусные последовательности РНК, которые очень важны для сборки рибосом и инициации трансляции. Последовательность Shine Dalgarno является сайтом связывания рибосом в матричной РНК бактерий и архей, тогда как последовательность Козака является сайтом инициации трансляции белка в большинстве эукариотических матричных РНК. Таким образом, это суммирует разницу между последовательностями Шайна Далгарно и Козака.
