Основное различие между QTL и GWAS заключается в типе последовательностей, используемых в анализе. QTL использует локусы генов сцепления для анализа фенотипических признаков, связанных с полигенным наследованием, в то время как GWAS использует последовательности всего генома для анализа однонуклеотидных полиморфизмов определенного состояния.
Карты QTL и GWAS играют важную роль в генетическом анализе различных признаков. Кроме того, они важны при анализе различных болезненных состояний с неизвестной этиологией. Кроме того, последовательность играет ключевую роль в обоих методах. Эти методы могут быть дополнительно объединены с другими высокопроизводительными методами для повышения точности и прецизионности.
Что такое QTL?
QTL расшифровывается как Quantitative Trait Locus. Это область ДНК, связанная с фенотипическим признаком. Как правило, QTL вызывает полигенные эффекты. Распределение QTL различается, и количество QTL указывает на степень изменчивости определенного фенотипического признака. Кроме того, они обычно кодируют базовые непрерывные черты, а не дискретные черты.
После идентификации областей QTL важно секвенировать конкретную область QTL. Кроме того, чтобы упростить исследования и исследования, секвенирование и хранение данных о последовательностях общих областей QTL происходит с участием биоинформатики. Мы называем этот метод сопоставлением QTL. Впоследствии создается база данных с последовательностями областей QTL.
Рисунок 01: Сканирование QTL
Кроме того, применение последовательностей QTL в основном зависит от инструмента BLAST, с помощью которого можно определить сходство последовательностей. Это важно для установления взаимоотношений между организмами. Кроме того, это важно для определения сложности конкретного полигенного фенотипа. Это также определяет эволюцию конкретной черты.
В настоящее время анализ QTL сочетается с другими высокопроизводительными методами, такими как ДНК-микрочипы. Это важно при экспрессионном анализе фенотипа. В настоящее время ученые очень заинтересованы в разработке базы данных QTL, поскольку регионы QTL отвечают за многие важные признаки различных видов.
Что такое GWAS?
GWAS расшифровывается как «Исследование геномных ассоциаций». Это также относится к исследованиям ассоциаций всего генома. Эти исследования сосредоточены в основном на обсервационных исследованиях. Он анализирует генетические варианты разных людей, обычно связанные с определенным признаком. Более того, для анализа GWAS важен весь геном.
Рисунок 02: GWAS
GWAS является важным инструментом в анализе однонуклеотидных полиморфизмов, связанных с различными болезненными состояниями. Это также сравнительное исследование различных однонуклеотидных полиморфизмов в широкой популяции. Кроме того, выборка исследования GWAS очень высока; следовательно, он также принимает формат поперечного когортного исследования.
Кроме того, первое исследование GWAS было проведено в отношении инфаркта миокарда и анализа генов, связанных с инфарктом миокарда. В настоящее время GWAS играет важную роль в определении генетического фона сложных заболеваний неизвестной этиологии.
Каковы сходства между QTL и GWAS?
- Они полагаются на данные о последовательностях ДНК для анализа.
- Оба связаны с генетическим фоном различных персонажей.
- Кроме того, им требуются инструменты биоинформатики для вывода и интерпретации результатов.
- Они выполняются на больших популяциях.
В чем разница между QTL и GWAS?
QTL анализирует фенотипические признаки, связанные с полигенным наследованием, используя локусы связанных генов, в то время как GWAS анализирует однонуклеотидные полиморфизмы определенного состояния, используя последовательности всего генома. Таким образом, в этом ключевое отличие QTL от GWAS. Картирование QTL является сравнительно менее сложным методом, чем GWAS, поскольку требует секвенирования всего генома.
Приведенная ниже инфографика суммирует разницу между QTL и GWAS в табличной форме.
Резюме – QTL против GWAS
Картирование QTL и GWAS играют важную роль в определении генетического фона различных фенотипических признаков. Они также помогают в анализе генетического фона различных заболеваний. Картирование QTL картирует гены сцепления, ответственные за непрерывные признаки, а также включает картирование генов полигенного наследования. GWAS, с другой стороны, имеет место при анализе всего генома на предмет однонуклеотидных полиморфизмов. Кроме того, это происходит в большей части населения. Таким образом, это краткое изложение различий между QTL и GWAS.
