Ключевое различие между геном-кандидатом и GWAS заключается в том, что подход с геном-кандидатом исследует генетическую изменчивость в пределах небольшого числа заранее заданных представляющих интерес генов, в то время как GWAS исследует весь геном на наличие общей генетической вариации, лежащей в основе определенного болезненного состояния.
Подход с использованием генов-кандидатов и полногеномные ассоциативные исследования (GWAS) - это два метода, которые важны для выявления генетической предрасположенности к заболеваниям. Подход с использованием генов-кандидатов основан на предварительно заданном небольшом количестве генов, в то время как GWAS основан на тестировании всего генома. Следовательно, подход с использованием генов-кандидатов требует предварительных знаний о генах, имеющих отношение к заболеванию, в отличие от GWAS.
Что такое ген-кандидат?
Подход с использованием генов-кандидатов - это один из методов, который исследует связь между генетическими вариациями в заранее заданных представляющих интерес генах и фенотипами или болезненными состояниями. При таком подходе необходимо иметь предварительные знания о биологическом функциональном влиянии гена на рассматриваемый признак или заболевание. Основываясь на этих знаниях, небольшое количество генов отбирается и анализируется на предмет генетической изменчивости.
Рисунок 01: Подход с использованием генов-кандидатов
Выбор генов осуществляется на основе биологической, физиологической и функциональной значимости рассматриваемого заболевания при таком подходе. Этот подход часто разрабатывается как исследование случай-контроль.
Что такое GWAS?
GWAS расшифровывается как «Исследование геномных ассоциаций». Это также относится к полногеномным ассоциативным исследованиям. Эти исследования сосредоточены в основном на обсервационных исследованиях. Они анализируют генетические варианты разных людей, обычно связанные с определенным признаком. Весь геном важен для анализа GWAS.
GWAS является важным инструментом в анализе однонуклеотидных полиморфизмов, связанных с различными болезненными состояниями. Это сравнительное исследование различных однонуклеотидных полиморфизмов в широкой популяции. Выборка исследования GWAS очень высока; следовательно, он также принимает формат поперечного когортного исследования.
Рисунок 02: GWAS
Первое исследование GWAS было проведено в отношении инфаркта миокарда и анализа генов, связанных с инфарктом миокарда. В настоящее время GWAS играет важную роль в определении генетического фона сложных заболеваний неизвестной этиологии.
Каковы сходства между геном-кандидатом и GWAS?
- И подход с использованием генов-кандидатов, и GWAS представляют собой методы, которые анализируют генетическую связь между генотипом и фенотипом заболевания.
- Оба подхода помогают понять генетические основы предрасположенности к болезням.
В чем разница между геном-кандидатом и GWAS?
Подход с использованием генов-кандидатов основан на генах-кандидатах или заранее определенных генах, в то время как GWAS основан на полном геноме. Итак, это ключевое различие между геном-кандидатом и GWAS. Кроме того, в подходе генов-кандидатов выбор генов необходим, в то время как в GWAS он не нужен.
Более того, подход с использованием генов-кандидатов требует предварительных знаний о генах, имеющих отношение к заболеванию, в то время как для GWAS это не обязательно.
Ниже на инфографике представлено более подробное сравнение различий между геном-кандидатом и GWAS.
Резюме – Ген-кандидат против GWAS
Ген-кандидат и GWAS - это два исследования ассоциации генов. Подход с использованием генов-кандидатов фокусируется на генетической изменчивости, связанной с заболеванием, в рамках небольшого числа заранее определенных генов. Напротив, GWAS исследует генетические вариации, связанные с заболеванием, в пределах всего генома. Итак, это ключевое различие между геном-кандидатом и GWAS. Оба метода важны для понимания генетической основы предрасположенности к болезням.
