Ключевая разница – генотипирование и секвенирование
Генотипирование и секвенирование - это два метода, применяемые для получения информации о нуклеиновых кислотах, в основном о ДНК организма. Ключевое различие между генотипированием и секвенированием заключается в том, что генотипирование - это процесс определения того, каким генетическим вариантом обладает человек, с помощью маркеров, а секвенирование - это определение правильного порядка нуклеотидной последовательности в данном фрагменте ДНК.
Что такое генотипирование?
Генотипирование – это определение генетического состава человека с использованием последовательности ДНК и маркеров, а также сравнение и идентификация его наследственности. Генотипирование важно в эволюционной биологии, популяционной биологии, таксономии, экологии и генетике организмов. Это может быть выполнено с помощью различных методов, включая секвенирование ДНК, полимеразную цепную реакцию, полиморфизм длин рестрикционных фрагментов (RFLP), случайное амплифицированное полиморфное обнаружение, полиморфизм длин амплифицированных фрагментов (AFLP), ДНК-микрочипы и т. д.
Генотипирование включает в себя секвенирование отдельных небольших фрагментов последовательностей ДНК и определение родства генетического состава с другими людьми с использованием генетических маркеров. Он определяет однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) среди людей или конкретных аллелей. Генотипирование применимо к широкому кругу организмов, включая человека. Он также применим к микроорганизмам, таким как вирусы, грибы и т. д., и может использоваться для определения их генетических вариантов с эталонными профилями. В молекулярной эпидемиологии и судебной микробиологии борьба с патогенами, особенно с микроорганизмами, осуществляется с помощью информации, полученной при генотипировании. Генотипирование очень важно при анализе родословной. Людей генотипируют для подтверждения материнства и отцовства. Генотип покажет доминантные и рецессивные аллели генов, которые определяют определенные черты.
Рисунок_1: Генотипирование RFLP
Что такое секвенирование?
Секвенирование - это процесс определения правильного порядка нуклеотидов в данном фрагменте ДНК или РНК. Практически вся информация, необходимая для роста и развития организма, закодирована в его геноме. Наличие методов получения и разделения фрагментов нуклеиновых кислот длиной в несколько сотен нуклеотидов привело к разработке методик определения точной нуклеотидной последовательности данного фрагмента ДНК или РНК. Сегодня доступны различные типы методов секвенирования. Эти методы секвенирования вместе с технологиями создания геномных библиотек, представляющих весь геном организма, облегчают секвенирование всего генома этого организма, делая глубокий анализ генных структур, функций генов, местонахождения генов, экспрессии генов, картирование генов, регуляторные области генов и т. д.
Полные геномы многих вирусов, нескольких бактерий, архебактерий, дрожжей и некоторых других организмов были секвенированы и нанесены на карту. Проект генома человека позволил секвенировать и картировать весь геном человека и опубликовать его первый проект в 2003 году. Это важная веха в развитии биологии. Последовательности генома человека в настоящее время используются в медицинском секторе для выявления генетических причин редких заболеваний, выявления риска заболеваний у новорожденных, выявления генетических деталей различных видов рака, разработки новых терапевтических средств и новых диагностических инструментов и т. д.
В мире растений секвенированы геномы риса и арабидопсиса. Знание этих последовательностей, несомненно, произведет революцию в нашем понимании того, как функционируют клетки и организмы.
Рисунок_2: Авторадиограмма секвенирования по Сэнгеру
В чем разница между генотипированием и секвенированием?
Генотипирование и секвенирование |
|
| Генотипирование - это процесс определения генетического состава особи и проверки группы или таксономии этого организма. | Секвенирование - это процесс определения точного порядка нуклеотидов данного фрагмента ДНК или РНК. |
| Техники | |
| RFLP, секвенирование генов, ПЦР, ДНК-микрочипы, AFLP и т. д. | Секвенирование по Сэнгеру, секвенирование по Гилберту, пиросеквенирование, секвенирование нового поколения, секвенирование дробовиком и т. д. |
| Основные проблемы | |
| Это больше касается того, дают ли различия генотипов фактические различия фенотипов. | Это больше касается порядка нуклеотидов и его различий и изменений с другими организмами. |
Резюме – Генотипирование и секвенирование
Генотипирование и секвенирование полезны для изучения генетической информации организмов. Генотипирование - это процесс определения вариаций генотипов среди людей и нахождения их категорий. Секвенирование - это процесс определения правильного порядка нуклеотидов в интересующем фрагменте или области ДНК. Оба метода предоставляют важную информацию о генах и геномах.
