Ключевое различие между секвенированием всего генома и секвенированием экзома заключается в том, что секвенирование всего генома секвенирует весь геном организма, в то время как секвенирование экзома секвенирует только экзом или кодирующие белок гены организма.
Секвенирование - это метод, который определяет точный порядок нуклеотидов в конкретной молекуле ДНК. Он просто отражает правильный порядок четырех основ; аденин (А), гуанин (Г), цитозин (Ц) и тимин (Т) во фрагменте ДНК. Существует несколько методов секвенирования, таких как секвенирование по Сэнгеру, секвенирование следующего поколения и т. д. Кроме того, секвенированию может подвергаться либо полный геном организма (полногеномное секвенирование), либо только гены, кодирующие белок в геноме (экзомное секвенирование).
Что такое полногеномное секвенирование?
Геном человека содержит почти три миллиарда пар оснований ДНК. Полногеномное секвенирование - это метод, который секвенирует полный геном организма. Таким образом, при секвенировании всего генома рассматривается весь набор молекул ДНК, включая экзомы, интроны, межгенные пространства и т. д. Более того, секвенирование всего генома секвенирует не только геном, находящийся внутри ядра, но и митохондриальную ДНК..
Рисунок 01: Секвенирование всего генома
При подготовке к этому секвенированию первым шагом является выделение всей ДНК. Затем выделенная ДНК подвергается процедуре секвенирования с использованием подходящего метода секвенирования. Анализируя полученные последовательности с помощью инструмента биоинформатики, мы можем обнаружить редкие заболевания, рак, инфекционные заболевания и т. д.
Что такое секвенирование экзома?
Экзом - это часть генома, которая содержит около 1,5% генома и представляет собой совокупность экзонов. Экзоны - это последовательности, которые транскрибируются в мРНК, а затем в конечный белковый продукт. Следовательно, секвенирование экзома секвенирует все кодирующие белок последовательности в геноме. Секвенирование экзома выявляет генетические нарушения, поскольку большинство генетических нарушений возникает из-за мутаций генов, кодирующих белок. Следовательно, в диагностических процессах генетических нарушений часто используется секвенирование экзома в качестве метода диагностики заболевания. Кроме того, по сравнению с приложением для секвенирования всего генома для генетического тестирования, секвенирование экзома занимает меньше времени и дешевле.
Рисунок 02. Секвенирование экзома
При секвенировании экзома, во-первых, необходимо выбрать из общей ДНК только кодирующие белок последовательности. Обратите внимание, что у людей имеется около 180 000 кодирующих белок последовательностей. Затем экзом секвенируется с использованием метода высокопроизводительного секвенирования.
Каковы сходства между полногеномным секвенированием и экзомным секвенированием?
- Секвенирование всего генома и секвенирование экзома - два приложения секвенирования.
- Оба метода полезны для определения правильного порядка нуклеотидной последовательности в обоих методах.
- Кроме того, биоинформатика помогает в обоих методах анализа данных.
В чем разница между секвенированием всего генома и секвенированием экзома?
Секвенирование всего генома секвенирует всю ДНК генома организма, в то время как секвенирование экзома секвенирует только кодирующие белок последовательности из генома. Следовательно, в этом принципиальное различие между секвенированием всего генома и секвенированием экзома. Кроме того, хотя оба метода широко используются для определения правильного порядка нуклеотидной последовательности, секвенирование всего генома является дорогостоящим и требует больше времени, чем секвенирование экзома..
Приведенная ниже инфографика показывает разницу между секвенированием всего генома и секвенированием экзома.
Резюме – Секвенирование всего генома и секвенирование экзома
Секвенирование выявляет точный порядок оснований во фрагменте ДНК, и это может быть как секвенирование всего генома, так и секвенирование экзома. Здесь секвенирование всего генома секвенирует полный геном организма, в то время как секвенирование экзома секвенирует только кодирующие белок последовательности в геноме. Учитывая их применение, секвенирование всего генома полезно для анализа генетических аберраций, таких как вариации отдельных нуклеотидов, делеции, вставки и т. Д., Во всем геноме, в то время как секвенирование экзома полезно для выявления генетических заболеваний. Следовательно, в этом разница между секвенированием всего генома и секвенированием экзома.
