Ключевое различие между мотивом и доменом заключается в том, что мотив не является независимо стабильным, в то время как домен является независимо стабильным.
Белки являются важными биологическими макромолекулами, присутствующими в нашем организме. С другой стороны, генетический код гена определяет аминокислотную последовательность белка. Кроме того, белки имеют первичную, вторичную и третичную структуру. Первичная структура представляет собой аминокислотную последовательность полипептидной цепи. Когда полипептидные цепи складываются друг с другом, образуется вторичная структура белка. Альфа-спирали, бета-листы и супервторичные структуры относятся к вторичным структурам. Определенные группы сверхвторичных элементов известны как белковые мотивы. Третичная структура белка относится к его трехмерной структуре, которая определяет функцию белка. Домен представляет собой свернутую часть белковой молекулы, которая имеет глобулярную форму и выполняет дискретную функцию. Это фундаментальная функциональная и трехмерная структура белка.
Что такое мотив?
Мотив – это определенная группировка супервторичных элементов белков, таких как альфа-спирали и бета-структуры. Они представляют собой некие паттерны, присутствующие в разных белках. Мотивы описывают схемы складывания вторичных структурных элементов и их взаимодействия. Эти паттерны складывания стабилизируются за счет сходных связей, присутствующих в третичных структурах. Однако они не так сложны, как третичные структуры.
Рисунок 01: Мотив
Они представляют собой простые комбинации вторичных структур белков. Мотив нестабилен сам по себе. Более того, мотивы объясняют структуру белка, но не предсказывают функцию белка. Примерами белковых мотивов являются мотив бета-альфа-бета, мотив греческого ключа, бета-бочка, мотив бета-меандра и т. д.
Что такое домен?
Домен - это фундаментальная, функциональная и трехмерная единица белка. Он выполняет определенную функцию. Один белок может иметь несколько различных доменов. Каждый домен является независимой единицей. Это шаровидная структура. Он отвечает за определенную функцию или взаимодействие. Домены можно использовать для выдвижения гипотезы о функции неохарактеризованного белка. При анализе белка это необходимо учитывать, поскольку домены являются функциональными единицами белка.
Рисунок 02: Три разных домена пируваткиназы
Домены - это очень стабильные и компактные структуры. Их легко отличить от других регионов. Пируваткиназа имеет три различных домена, как показано на рисунке 02. Длина домена может варьироваться, и средняя длина составляет 100 аминокислот. Каждый домен содержит гидрофобное ядро, построенное из вторичных структурных единиц. Несколько доменов в совокупности составляют третичную структуру белка.
Каковы сходства между мотивом и доменом?
- Мотив и домен являются единицами, присутствующими в белковых молекулах сами по себе.
- Они полезны при классификации семейств белков.
В чем разница между мотивом и доменом?
Мотив - это определенная группировка супервторичных элементов белков, таких как альфа-спирали и бета-структуры, а домен - это функциональная единица белка. Кроме того, мотив представляет собой вторичную структуру, а домен отвечает за третичную структуру белка. Более того, домен является самостоятельной единицей, в отличие от мотива. Кроме того, домен отображает функцию белка, а мотив - нет. Таковы основные различия между мотивом и доменом. Приведенная ниже инфографика представляет разницу между мотивом и доменом в табличной форме.
Резюме – мотив против домена
Мотив – это расположение вторичных структур белковой молекулы. Обычно он нестабилен сам по себе, в отличие от домена. Домен представляет собой независимо стабильную структуру белка. Следовательно, это может быть часть или целая белковая молекула. Это трехмерная фундаментальная функциональная единица белка. Более того, у него есть функция, и он является самостоятельной единицей. Мотив может быть частью домена. Но домен не может быть частью мотива. В этом разница между мотивом и доменом.
