Ключевое различие между белковой субъединицей и доменом заключается в том, что белковая субъединица представляет собой отдельную полипептидную цепь белка, которая собирается с другими полипептидными цепями с образованием белкового комплекса, в то время как белковый домен представляет собой непрерывный участок полипептидной цепи. белка, который часто самостоятельно сворачивается в компактную, локальную и полунезависимую единицу.
Белковая субъединица и домен являются очень важными частями мультимерного белка. Белки представляют собой полимеры, состоящие из полипептидов. Каждая полипептидная цепь состоит из мономера, известного как аминокислота. Сложный белок содержит отдельные структурные единицы, такие как субъединицы, домены, мотив и складку. Эти структурные единицы сложного белка чрезвычайно важны для его структуры и, в конечном счете, для его функции.
Что такое белковая субъединица?
Белковая субъединица представляет собой отдельную полипептидную цепь белка, которая собирается с другими полипептидными цепями с образованием белкового комплекса. В структурной биологии белковая субъединица представляет собой единую белковую молекулу, которая совместно с другими белковыми молекулами собирается в белковый комплекс. Встречающиеся в природе белки имеют относительно небольшое количество субъединиц, таких как гемоглобин и ДНК-полимераза. Поэтому их называют олигомерными. Другие белки состоят из большого количества субъединиц, поэтому их называют мультимерными. Например, микротрубочки и другие белки цитоскелета являются мультимерными. Субъединицы мультимерного белка могут быть идентичными (гомологичными) или совершенно разными (гетерологичными).
Рисунок 01: Белковая субъединица
В некоторых мультимерных белках одна субъединица может быть каталитической субъединицей. С другой стороны, другая является регуляторной субъединицей. Функция каталитической субъединицы - катализировать ферментативную реакцию, тогда как функция регуляторной субъединицы - способствовать или ингибировать ее активность. Фермент, который в собранном виде состоит как из каталитических, так и из регуляторных субъединиц, обычно называют холоферментом. Например, фермент класса I фосфоинозитид-3-киназа имеет каталитическую субъединицу р110 и регуляторную субъединицу р85. Кроме того, белок должен иметь один ген для каждой субъединицы. Это связано с тем, что субъединица состоит из отдельной полипептидной цепи, имеющей один кодирующий ген.
Что такое белковый домен?
Белковый домен представляет собой непрерывный участок полипептидной цепи белка, который часто независимо сворачивается в компактные, локальные и полунезависимые единицы. Домен белка также известен как участок полипептидной цепи белка, который самостабилизируется и складывается независимо от остальных. Они представляют собой отдельную структурную и функциональную единицу в белке. Обычно домены отвечают за определенную функцию или взаимодействие, которое способствует общей роли белка. Например, домен SH3 состоит примерно из 50 аминокислотных остатков. Они встречаются в различных белках, включая адапторные белки, фосфатидилинозитол3-киназы, фосфолипазы и миозины. Эти домены SH3 участвуют в межбелковых взаимодействиях.
Рисунок 02: Белковые домены
Домены имеют длину от 50 до 250 аминокислот. Самые короткие домены, такие как цинковый палец, стабилизированы ионами металлов и дисульфидными мостиками. Домен часто производит функциональные единицы, такие как кальций-связывающий домен EF-hand кальмодулина. Кроме того, с помощью генной инженерии домены могут быть заменены между одним белком и другим для создания химерных белков.
Каковы сходства между белковой субъединицей и доменом?
- Белковая субъединица и домен являются структурными единицами мультимерного белка.
- Оба состоят из аминокислот.
- Они связаны с термином «полипептидная цепь».
- Более того, они оба чрезвычайно важны для общей функции белка.
В чем разница между белковой субъединицей и доменом?
Белковая субъединица представляет собой отдельную полипептидную цепь белка, которая собирается с другими полипептидными цепями с образованием белкового комплекса. С другой стороны, белковый домен представляет собой непрерывный участок полипептидной цепи белка, который часто независимо сворачивается в компактные, локальные и полунезависимые единицы. Итак, в этом ключевое различие между белковой субъединицей и доменом. Более того, белковая субъединица больше по размеру, чем белковый домен.
В следующей таблице приведены различия между белковой субъединицей и доменом в табличной форме.
Резюме – Белковые субъединицы и домены
Стандартными блоками белков являются аминокислоты. Белки образуются путем конденсации аминокислот. Белковые структуры имеют размер от десятков до нескольких тысяч аминокислот. Структура белка стабилизируется нековалентными взаимодействиями, такими как водородные связи, ионные связи, силы Ван-дер-Ваальса, гидрофобные связи и ковалентные взаимодействия, такие как дисульфидные связи. Сложный белок содержит отдельные структурные единицы, такие как субъединицы, домены, мотив и складку. Белковая субъединица представляет собой отдельную полипептидную цепь белка, которая собирается с другими полипептидными цепями с образованием белкового комплекса. С другой стороны, белковый домен представляет собой участок полипептидной цепи белка, который самостабилизируется и укладывается независимо от остальных. Таким образом, это краткое изложение различий между белковой субъединицей и доменом.
