Ключевое различие между Rho-зависимой и Rho-независимой терминацией заключается в том, что при Rho-зависимой терминации Rho-фактор связывается с транскриптом и терминирует транскрипцию, разрывая водородные связи между матрицей и транскриптом, в то время как Rho-независимая терминация завершает транскрипцию с помощью создавая структуру петли-шпильки, а затем область, богатую U, в транскрипте.
Транскрипция - один из двух этапов экспрессии генов. Это процесс, который создает последовательность мРНК из генетической информации, скрытой в последовательности ДНК гена. Транскрипция происходит в три этапа: инициация, элонгация и терминация. Фермент РНК-полимераза связывается с промоторной последовательностью гена и начинает катализировать синтез цепи РНК. Пока не будет найдена последовательность терминатора, РНК-полимераза добавляет нуклеотиды и строит цепь РНК. У прокариот терминация происходит посредством двух основных стратегий терминации: Rho-зависимая терминация и Rho-независимая терминация. Ро-фактор - это белок, обладающий геликазной активностью.
Что такое Rho-зависимое завершение?
Rho-зависимая терминация является одним из двух типов стратегий терминации транскрипции, встречающихся у прокариот. Ро-фактор - это белок, обладающий геликазной активностью.
Рисунок 01: Завершение, зависящее от Rho
Белок Rho связывается с РНК-транскриптом и движется вдоль РНК-полимеразы в 5’-3’-направлении, способствуя диссоциации водородных связей между матрицей ДНК и РНК-транскриптом. Когда Rho-фактор достигает транскрипционного пузыря, он разрывает гибрид ДНК/РНК и высвобождает транскрипт из транскрипционного пузыря. Когда это происходит, транскрипция прерывается.
Что такое независимое завершение Rho?
Rho независимая терминация является второй стратегией терминации прокариотической транскрипции. Обычно терминаторная область имеет инвертированную повторяющуюся последовательность. Сразу после последовательности инвертированных повторов находится область, богатая аденином (AAAA). Когда РНК-полимераза движется вперед, она создает последовательность мРНК. Поскольку две области комплементарны в области инвертированной повторяющейся последовательности, она образует структуру шпильки-петли из-за водородных связей. Следующим регионом будет регион, богатый ураном. Структура шпильки прекращает активность РНК-полимеразы.
Рисунок 02: Независимое окончание Rho
Кроме того, в богатых U регионах существуют слабые взаимодействия между U-основаниями транскрипта и A-основаниями матрицы. Эти слабые аденин-урациловые связи дестабилизируют матрицу ДНК и транскрипт РНК и разделяют друг друга. В конце транскрипт освобождается от сайта транскрипции.
Каковы сходства между Rho-зависимым и Rho-независимым завершением?
- Rho-зависимая и Rho-независимая терминация - две основные стратегии терминации, обнаруженные у прокариот.
- Обе формы высвобождают транскрипт из матрицы ДНК, чтобы прекратить транскрипцию.
В чем разница между Rho-зависимым и Rho-независимым завершением?
Rho-зависимая терминация опосредуется белком Rho, в то время как Rho-независимая терминация происходит посредством образования структуры шпильки-петли. Итак, в этом ключевое различие между Rho-зависимым и Rho-независимым окончанием. Кроме того, белок Rho использует энергию АТФ, в то время как терминация, независимая от Rho, не включает белок Rho и не использует энергию АТФ. Следовательно, это также существенное различие между Rho-зависимым и Rho-независимым окончанием.
Приведенная ниже инфографика показывает больше сравнений, связанных с разницей между Rho-зависимым и Rho-независимым окончанием.
Резюме – Ро-зависимое и Ро-независимое прекращение
Rho-зависимая и Rho-независимая терминация являются двумя основными механизмами терминации транскрипции, встречающимися у прокариот. Белок Rho отвечает за терминацию транскрипции при Rho-зависимой терминации. Напротив, Rho-независимая терминация происходит посредством образования структуры петли-шпильки. Итак, это ключевое различие между Rho-зависимым и Rho-независимым окончанием.
