Ключевое различие между изошизомерами и изокаудомерами заключается в том, что изошизомеры распознают и расщепляют один и тот же сайт рестрикции или узнавания, в то время как изокаудомеры распознают несколько разные сайты рестрикции и расщепляют по одному и тому же сайту.
Рестрикционные ферменты или эндонуклеазы рестрикции представляют собой тип нуклеаз, расщепляющих двухцепочечную ДНК. Они способны распознавать определенные последовательности, называемые сайтами рестрикции, которые имеют палиндромное происхождение. Бактерии вырабатывают ферменты рестрикции против чужеродных патогенов, особенно против вирусов. Это форма защитного механизма, проявляемая бактериями. В зависимости от структуры фермента и природы разрезов различают три типа рестрикционных ферментов: рестрикционные ферменты I типа, рестрикционные ферменты II типа и рестрикционные ферменты II типа. Более того, в зависимости от биохимической активности и источника выделения различают три типа рестриктаз: изошизомеры, неошизомеры и изокаудомеры.
Что такое Изошизомеры?
Изошизомеры - это тип фермента рестрикции, который происходит из разных источников, но распознает и расщепляет один и тот же сайт рестрикции в ДНК. Следовательно, два изошизомера имеют один и тот же сайт узнавания. Они расщепляются в одном и том же сайте, поэтому они специфичны для одной и той же последовательности распознавания. Например, рестриктазы SphI и BbuI представляют собой два изошизомера, которые распознают и расщепляют CGTAC/G.
Рисунок 01: Рестрикционный фермент
Другая пара изошизомеров - HpaII и MspI. Оба они распознают последовательность 5'-CCGG-3' и расщепляют ДНК. Более того, Bsp EI и Acc III также являются изошизомерами, происходящими из видов Bacillus и Acinetobacter calcoaceticus соответственно. Выделение изошизомеров можно проводить из разных бактерий. Поскольку они происходят из разных бактерий, их условия ограничения могут отличаться друг от друга.
Что такое изокаудомеры?
Изокаудомеры - это тип рестрикционных ферментов, которые распознают слегка отличающиеся последовательности, но расщепляются в одном и том же месте, образуя одни и те же концы. Изокаудомеры также происходят от разных бактерий. Sau3a и BamHI представляют собой пару изокаудомеров. Они производят липкий конец 5'-GATC-3' после расщепления того же сайта. Другой парой изокаудомеров является NcoI из Nocardia corallina и PagI из Pseudomonas alcaligenes. Эти два фермента также связываются с разными последовательностями узнавания, но разрезаются в одном и том же месте и образуют одни и те же липкие концы. Следовательно, образующиеся режущие концы совместимы друг с другом, и их можно лигировать друг с другом. XhoI, PspXI и SalI также являются изокаудомерами.
Каковы сходства между изошизомерами и изокаудомерами?
- Изошизомеры и изокаудомеры представляют собой два типа ферментов рестрикции.
- Два изошизомера имеют один и тот же сайт пищеварения, подобно двум изокаудомерам, которые имеют один и тот же сайт пищеварения.
- Они имеют прокариотическое происхождение.
- У обоих есть сайт рестрикции, а также сайт переваривания.
- Они производят совместимые друг с другом концы.
- Кроме того, эти ферменты являются полезными инструментами в технологии рекомбинантной ДНК.
В чем разница между изошизомерами и изокаудомерами?
Изошизомеры представляют собой рестрикционные ферменты, которые распознают одну и ту же последовательность ДНК и расщепляют один и тот же сайт рестрикции, в то время как изокаудомеры представляют собой рестрикционные ферменты, которые распознают несколько отличающиеся последовательности ДНК, но образуют одинаковые липкие концы, разрезая один и тот же сайт. Итак, в этом ключевое различие между изошизомерами и изокаудомерами.
Приведенная ниже инфографика показывает разницу между изошизомерами и изокаудомерами.
Резюме – Изошизомеры против изокаудомеров
Изошизомеры - это ферменты рестрикции, которые узнают одну и ту же последовательность ДНК и расщепляют ее в одном и том же сайте. С другой стороны, изокаудомеры представляют собой рестрикционные ферменты, которые распознают немного отличающиеся последовательности и расщепляют в одном и том же сайте, образуя одинаковые концы. Таким образом, в этом ключевое различие между изошизомерами и изокаудомерами. SphI, BbuI, HpaII и MspI являются несколькими примерами изошизомеров, тогда как Sau3a и BamHI являются двумя примерами изокаудомеров. И изошизомеры, и изокаудомеры естественным образом производятся бактериями.
