Ключевое различие между сигма-фактором и ро-фактором заключается в том, что сигма-фактор - это белок, необходимый для инициации транскрипции у бактерий, а ро-фактор - это белок, необходимый для терминации транскрипции у бактерий.
Сигма-фактор и ро-фактор являются двумя важными факторами бактериальной транскрипции. Бактериальная транскрипция - это процесс, при котором фрагмент бактериальной ДНК копируется во вновь созданную цепь мРНК (информационная РНК). Этот процесс катализируется ферментом, известным как РНК-полимераза. Бактерии в значительной степени полагаются на транскрипцию и трансляцию, чтобы правильно реагировать на окружающую среду. Бактериальная РНК-полимераза состоит из ядра и холоферментной структуры. Ядро содержит субъединицы β, β′, α и 2ω, а холофермент содержит сигма-фактор. Более того, вспомогательный фактор РНК-полимеразы, известный как ро-фактор, также очень важен для бактериальной транскрипции.
Что такое сигма-фактор?
Сигма-фактор или фактор специфичности - это белок, необходимый для инициации транскрипции у бактерий. Это бактериальный фактор инициации транскрипции. Этот фактор обеспечивает связывание фермента РНК-полимеразы со специфическим участком ДНК, называемым промоторным участком, во время транскрипции. Сигма-фактор обычно гомологичен фактору транскрипции B архей и фактору транскрипции эукариот TF11B. Более того, конкретный сигма-фактор данного гена варьируется в зависимости от гена и сигналов окружающей среды. Промоторы выбираются РНК-полимеразой в зависимости от связанного с ней сигма-фактора.
Рисунок 01: Сигма-фактор
Сигма-фактор также можно найти в хлоропластах растений как часть кодируемой пластидами полимеразы (PEP). Сигма-фактор и РНК-полимераза вместе известны как холофермент РНК-полимеразы. Молекулярная масса сигма-фактора составляет около 70 кДа. После инициации транскрипции сигма-фактор диссоциирует от комплекса. Затем РНК-полимераза продолжает элонгацию до окончания транскрипции.
Что такое Ро-фактор?
Rho фактор представляет собой прокариотический белок, участвующий в терминации транскрипции. Rho-фактор обычно связывается с сайтом паузы терминатора транскрипции. Этот сайт представляет собой открытую область одноцепочечной РНК рядом с открытой рамкой считывания в последовательностях, богатых цитозином и бедных гуанином. Это важный белок транскрипции у прокариот. У Escherichia coli ро-фактор составляет примерно 274,6 кДа гексамера идентичных субъединиц. Каждая субъединица имеет домен связывания РНК и домен гидролиза АТФ. Более того, функцией ро-фактора является активность геликазы.
Рисунок 02: Ро-фактор
Rho-фактор связывается с молекулой РНК, а затем использует свою АТФазную активность, чтобы обеспечить энергию для перемещения молекул РНК. Rho-фактор осуществляет транслокацию до тех пор, пока не достигает спиральной области РНК-ДНК, где он раскручивает гибридную (РНК-ДНК) дуплексную структуру. Этот процесс приостанавливает РНК-полимеразу в месте терминации, завершая процесс транскрипции.
Каковы сходства между сигма-фактором и Rho-фактором?
- Сигма-фактор и ро-фактор являются двумя важными факторами бактериальной транскрипции.
- Оба присутствуют только у прокариот.
- Это белки, состоящие из аминокислот.
- Оба являются белками, связывающими нуклеиновые кислоты.
- Прокариоты в значительной степени полагаются на эти факторы, чтобы генерировать мРНК, которые могут производить специфические белки и помогать им специфически реагировать на окружающую среду.
В чем разница между сигма-фактором и Rho-фактором?
Сигма-фактор - это белок, необходимый для инициации транскрипции у бактерий, а ро-фактор - это белок, необходимый для терминации транскрипции у бактерий. Итак, в этом ключевое различие между сигма-фактором и ро-фактором. Кроме того, сигма-фактор является ДНК-связывающим белком, а ро-фактор - РНК-связывающим белком.
Приведенная ниже инфографика представляет различия между сигма-фактором и ро-фактором в табличной форме для параллельного сравнения.
Резюме – Сигма-фактор против Ро-фактора
Транскрипция - это процесс, при котором информация в ДНК копируется в новую молекулу, называемую мРНК (информационная РНК). Эта м-РНК в конечном итоге участвует в производстве определенного белка. Сигма-фактор и ро-фактор являются двумя важными факторами бактериальной транскрипции. Это белки. Сигма-фактор участвует в инициации транскрипции у бактерий. Ро-фактор отвечает за терминацию транскрипции у бактерий. Таким образом, это краткое изложение различий между сигма-фактором и ро-фактором.
