Основное различие между ксиленцианолом и бромфеноловым синим заключается в том, что в 1% агарозном геле ксиленцианол мигрирует медленнее, тогда как бромфеноловый синий мигрирует быстрее.
Ксилолцианол и бромфеноловый синий важны как цветовые маркеры, которые можно использовать для мониторинга процесса электрофореза в агарозном геле и электрофореза в полиакриламидном геле.
Что такое ксиленцианол?
Ксилолцианол – это электрофоретический цветовой маркер или отслеживающий краситель. Это полезно для мониторинга процесса электрофореза в агарозном геле и электрофореза в полиакриламидном геле. Когда это вещество смешивается с образцом, концентрация этого вещества обычно становится около 0.005% до 0,03%. Некоторые синонимы, которые мы можем использовать для ксилолцианола, включают Acid Blue 147, ксилолцианол, ксилолцианол FF, ксилолцианол FF и т. д.
Химическая формула этого соединения C25H27N2NaO 6S2 Молярная масса ксилолцианола составляет 538,61 г/моль. Это вещество может мигрировать со скоростью около 4-5 тысяч пар оснований фрагментов ДНК в 1% агарозных гелях. Однако это зависит от используемого нами буфера. Как правило, ксиленцианол на 6% полиакриламидном геле может мигрировать со скоростью около 140 фрагментов ДНК в паре оснований. С другой стороны, он может мигрировать при электрофорезе в 20% денатурирующем полиакриламидном геле со скоростью олигонуклеотида из 25 оснований.
Количество доноров водородных связей у ксилолцианола составляет 2 млн, а количество акцепторов водородных связей равно 8. Количество вращающихся связей в этом соединении можно определить как 7. Сложность ксилолцианола можно описать как 1120 градусов. Он имеет определенное количество стереоцентров связи, равное 1.
Что такое бромфеноловый синий?
Бромфеноловый синий является полезным индикатором pH, который используется в качестве электрофоретического цветного маркера и красителя. Он имеет химическое название 3', 3', 5', 5'-тетрабромфенолсульфонфталеин, BPB. Химическая формула этого соединения C19H10Br4O5 S. Молярная масса этого соединения составляет 669,96 г/моль. Он не имеет запаха, и его плотность можно определить как 2,2 г/мл. Его температура плавления составляет 273 градуса по Цельсию, а температура кипения - 279 градусов по Цельсию. Мы можем приготовить его, медленно добавляя избыток брома к горячему раствору фенолсульфонфталеина в ледяной уксусной кислоте.
Бромфеноловый синий полезен в качестве кислотно-щелочного индикатора в диапазоне рН от 3,0 до 4,6. Он способен менять цвет с желтого при рН 3,0 на рН 4,6. Более того, это обратимая реакция. По структуре бромфеноловый синий подобен фенолфталеину.
Кроме того, мы можем использовать его в качестве цветового маркера для контроля процесса электрофореза в агарозном геле и электрофореза в полиакриламидном геле. Это вещество может нести отрицательный заряд при умеренном рН, когда оно может мигрировать в том же направлении, что и ДНК или белок в геле. Скорость миграции может варьироваться в зависимости от плотности геля и состава буфера. Однако в типичном 1% агарозном геле в 1 раз буфере ТАЕ или буфере ТВЕ это вещество мигрирует с той же скоростью, что и фрагмент ДНК длиной около 300 пар оснований.
В чем разница между ксиленцианолом и бромфеноловым синим?
Ксиленцианол и бромфеноловый синий являются важными цветовыми маркерами. Основное различие между ксиленцианолом и бромфеноловым синим заключается в том, что в 1% агарозном геле ксиленцианол мигрирует медленнее, тогда как бромфеноловый синий мигрирует быстрее.
Ниже приводится сводка различий между ксиленцианолом и бромфеноловым синим в табличной форме для параллельного сравнения.
Резюме – Ксилолцианол против бромфенолового синего
Ксилолцианол и бромфеноловый синий играют важную роль в качестве цветовых маркеров, используемых при мониторинге процесса электрофореза в агарозном геле и электрофореза в полиакриламидном геле. Основное различие между ксиленцианолом и бромфеноловым синим заключается в том, что в 1% агарозном геле ксиленцианол мигрирует медленнее, тогда как бромфеноловый синий мигрирует быстрее.
