Ключевое различие между ДНК-зондами и РНК-зондами заключается в том, что ДНК-зонды представляют собой фрагменты ДНК, комплементарные нуклеотидным последовательностям-мишеням, тогда как РНК-зонды представляют собой участки одноцепочечной РНК, которые представляют собой последовательности нуклеиновых кислот, комплементарные целевым последовательностям.
Зонд представляет собой искусственно синтезированную короткую последовательность ДНК или РНК, которая может быть помечена радиоактивно или нерадиоактивными молекулами. Он может иметь длину от 100 до 1000 оснований. Зонды полезны для обнаружения последовательностей нуклеотидов-мишеней, которые комплементарны последовательности зонда. После добавления зонды гибридизуются с комплементарными последовательностями или последовательностями-мишенями и делают их видимыми для идентификации последовательностей-мишеней, поскольку они несут радиоактивность. Зонды являются важными молекулярными инструментами во многих микробных и молекулярных областях, таких как обнаружение генетических заболеваний, вирусология, судебная патология, проверка отцовства, ДНК-дактилоскопия, RFLP, молекулярная цитогенетика, гибридизация in situ и т. д.
Что такое ДНК-зонды?
ДНК-зонды представляют собой одноцепочечные участки ДНК. Их можно использовать для обнаружения присутствия комплементарных последовательностей нуклеиновых кислот (последовательностей-мишеней) путем гибридизации. Как только зонд ДНК гибридизуется с комплементарной ему последовательностью, он образует двухцепочечный гибрид. Для их обнаружения ДНК-зонды обычно метят радиоизотопами, биотином, эпитопами или флуорофорами. ДНК-зонды, меченные биотином, можно обнаружить с помощью меченной стрептавидином щелочной фосфатазы рядом ферментативных и химических методов.
Рисунок 01: ДНК-зонд
Нуклеотидная последовательность ДНК-зонда известна. Это короткие последовательности длиной от 100 до 1000 пар оснований. Длинные ДНК-зонды могут быть получены с помощью технологии рекомбинантной ДНК. Их также можно получить с помощью ПЦР и клонирования. В клинических микробиологических лабораториях ДНК-зонды легко доступны для быстрой диагностики инфекционных заболеваний.
Что такое РНК-зонды?
РНК-зонды представляют собой одноцепочечные участки РНК. Они представляют собой последовательности, комплементарные целевым последовательностям в образце. Их обычно синтезируют с помощью РНК-полимераз бактериофагов SP6, T7 или T3 путем транскрипции ДНК in vitro. Длинные РНК-зонды могут быть получены путем транскрипции in vitro из линеаризованной плазмидной ДНК. Как правило, РНК-зонды прочно и прочнее связываются со своими комплементарными последовательностями, чем ДНК-зонды. Подобно зондам ДНК, зонды РНК также могут быть помечены во время их транскрипции.
Каковы сходства между зондами ДНК и РНК?
- И ДНК-, и РНК-зонды представляют собой одноцепочечные нуклеотидные последовательности.
- Оба созданы и синтезированы искусственно.
- Кроме того, они могут быть помечены радиоизотопами, эпитопами, биотином или флуорофорами.
- Они имеют сильное сродство к определенной целевой последовательности ДНК или РНК.
- Они используются в различных методах блоттинга и гибридизации in situ для обнаружения целевых последовательностей нуклеиновых кислот.
- Оба типа зондов могут быть гибридизированы с их комплементарными последовательностями.
- Они также используются для идентификации микроорганизмов и диагностики инфекционных, наследственных и других заболеваний.
В чем разница между зондами ДНК и РНК?
ДНК-зонд представляет собой короткий участок ДНК, комплементарный целевой последовательности. С другой стороны, РНК-зонд представляет собой короткий одноцепочечный участок РНК, комплементарный целевой последовательности. Таким образом, в этом ключевое различие между ДНК- и РНК-зондами. Кроме того, ДНК-зонды содержат A, T, C и G, а РНК-зонды содержат A, U, C и G.
Более того, еще одно различие между зондами ДНК и РНК заключается в их термодинамической стабильности. РНК-зонды демонстрируют большую термодинамическую стабильность по сравнению с ДНК-зондами.
Ниже в инфографике представлены важные различия между зондами ДНК и РНК.
Резюме – ДНК и РНК-зонды
Зонд представляет собой небольшой фрагмент ДНК или РНК, используемый для обнаружения наличия определенной последовательности в образце ДНК или РНК путем молекулярной гибридизации. ДНК-зонды представляют собой короткие одноцепочечные ДНК-фрагменты, тогда как РНК-зонды представляют собой короткие одноцепочечные последовательности РНК. Это известные последовательности. Термодинамическая стабильность выше у РНК-зондов, чем у ДНК-зондов. РНК-зонды связываются со своими комплементарными последовательностями прочнее, чем ДНК-зонды. Таким образом, это суммирует разницу между ДНК- и РНК-зондами.
