Ключевое различие между LAMP и тестом ПЦР заключается в том, что LAMP проводится при постоянной температуре (60-65°0C) для получения копий ДНК путем амплификации, в то время как ПЦР проводится использование серии изменений температуры для получения копий ДНК посредством амплификации.
LAMP и ПЦР - это методы амплификации in vitro, используемые для получения тысяч копий ДНК. Количество ДНК, продуцируемое в LAMP, намного выше, чем количество, продуцируемое методами ПЦР, такими как ОТ-ПЦР. LAMP является более новым методом по сравнению с методом ПЦР. Но технически просто и легко для подготовленного ученого выполнить в лабораторных условиях. Это делает его потенциально полезным методом для обнаружения COVID-19. Однако в настоящее время ОТ-ПЦР является стандартным тестом на COVID-19. Эти методы, хотя и хорошо известны исследователям и клиницистам, имеющим опыт амплификации ДНК, все же могут быть относительно неизвестны более широкому сообществу.
Что такое тест LAMP?
Петлевая изотермическая амплификация (LAMP) для анализов на COVID-19 начинается со сбора образцов из носа или горла с помощью тампона. Образцы также можно собирать с помощью других методов, таких как слизь при сильном кашле. Как и в методе ПЦР, таком как ОТ-ПЦР, вирусная РНК в образце сначала преобразуется в ДНК, что позволяет ее копировать. Реакция LAMP проводится при постоянной температуре (60-65°С0°СС).
Амплификацию вирусной ДНК с использованием технологии LAMP и реагентов можно обнаружить, когда реакционная смесь становится мутной из-за образования «пирофосфата магния». Эта облачность позволяет ученым и клиницистам легко диагностировать COVID-19. Точность результатов испытаний можно повысить, используя в реакционной смеси специальные флуоресцентные красители или красители, изменяющие цвет. Эти красители взаимодействуют с вирусной ДНК, и можно измерить интенсивность свечения или изменения цвета, чтобы получить примерное количество молекул вирусной РНК, которое изначально было в образце.
Что такое ПЦР-тест?
ПЦР - очень распространенный научный метод, который уже 20-30 лет широко используется в исследованиях и медицине для обнаружения ДНК. ПЦР-тесты используются непосредственно для обнаружения антигена путем обнаружения вирусной РНК. Как правило, вирусная РНК присутствует в организме до обнаружения антител или появления симптомов заболевания. Таким образом, тест ПЦР может определить, есть ли у кого-то вирус на ранней стадии. В настоящее время ПЦР является стандартным тестом для выявления COVID-19. Существуют различные типы методов ПЦР, такие как ПЦР в реальном времени, вложенная ПЦР, мультиплексная ПЦР, ПЦР с горячим стартом и ПЦР дальнего действия и т. д. ПЦР использует серию изменений температуры для получения копий ДНК посредством амплификации.
RT-PCR - это специальная версия методики PCR. Он используется при обнаружении РНК. Сейчас он используется для тестирования COVID-19. ОТ-ПЦР является достаточно чувствительным и надежным методом. В RT-PCR после сбора образца химические вещества используются для удаления нежелательных белков, жиров и других молекул, оставляя РНК позади. Ферменты тестового набора сначала преобразуют РНК в ДНК, которая затем амплифицирует вирусную ДНК для обнаружения вируса. Флуоресцентные красители обычно используются для связывания с амплифицированной ДНК и получения света. Это может быть прочитано машиной для получения результата теста.
В чем сходство между LAMP и ПЦР-тестом?
- Это техники усиления.
- Оба производят копии ДНК.
- Они являются более чувствительными и надежными методами, чем иммунные методы, такие как обнаружение антител.
- Они оба используются для тестирования на COVID-19.
В чем разница между LAMP и ПЦР-тестом?
Ключевое различие между тестами LAMP и ПЦР заключается в том, что в LAMP амплификация достигается при постоянной температуре (60-65°0C), а в ПЦР циклирование требуется температура. В настоящее время доступно несколько типов методов LAMP. Но наиболее важными для обнаружения COVID-19 являются изотермический метод, опосредованный петлей обратной транскрипции (RT-LAMP), и амплификация, опосредованная транскриптом (TMA). Кроме того, в настоящее время в клинической практике также доступны различные типы методов ПЦР для диагностики заболеваний, такие как ПЦР в реальном времени, ОТ-ПЦР, вложенная ПЦР, мультиплексная ПЦР, ПЦР с горячим стартом, ПЦР дальнего действия и т. д.
В приведенной ниже инфографике перечислены различия между тестами LAMP и ПЦР в табличной форме.
Резюме – Тест LAMP против ПЦР
Изотермическая амплификация, опосредованная петлей, аналогична ПЦР-тестам, таким как ОТ-ПЦР, но она производит больше копий вирусной ДНК при постоянной температуре. Тест полимеразной цепной реакции в настоящее время является наиболее распространенной и стандартной формой тестирования в мире для диагностики заболеваний, таких как диагностика COVID-19. Он считается достаточно надежным. ПЦР использует серию изменений температуры для получения копий ДНК посредством амплификации. Таким образом, это суммирует разницу между тестом LAMP и ПЦР.
