Ключевое различие между интронами группы I и группы II заключается в том, что в интронах группы I реакция сплайсинга инициируется гуанозиновым кофактором, а в интронах группы II реакция сплайсинга инициируется внутренним аденозином.
Пре-мРНК представляет собой первичный транскрипт, который имеет как интроны, так и экзоны. Пре-мРНК должна превращаться в мРНК перед трансляцией. Сплайсинг РНК или сплайсинг пре-мРНК является одной из таких посттранскрипционных модификаций. При сплайсинге РНК интроны удаляются из молекулы пре-мРНК, а экзоны соединяются вместе. Интроны группы I и группы II являются саморасщепляющимися интронами. Они отщепляются от молекулы пре-мРНК без помощи какого-либо другого фермента. Следовательно, они представляют собой РНК-ферменты или рибозимы, которые катализируют собственный сплайсинг из пре-мРНК. Более того, они имеют возможность выполнять функции мобильных элементов. Во время сплайсинга происходит серия реакций переэтерификации, чтобы вырезать интрон и лигировать экзоны. Эти рибозимы присутствуют во всех трех доменах, включая бактерии, археи и эукариоты.
Что такое интроны группы I?
Интроны группы I представляют собой тип саморасщепляющихся рибозимов, обнаруженных в бактериях, бактериофагах и эукариотах (органеллярные и ядерные геномы). Они находятся в основных генах. Они способны катализировать собственный сплайсинг из молекулы пре-мРНК. Интроны группы I могут иметь от нескольких сотен до трех тысяч нуклеотидов. Более того, они демонстрируют небольшое сходство последовательностей между организмами.
Рисунок 01: Интроны группы I
Вторичные структуры высоко консервативны в четырех коротких участках. Существует две стадии реакции переэтерификации сплайсинга. Интроны группы I инициируют механизм сплайсинга путем нуклеофильной атаки 3'-гидроксила кофактора гуанозина в сайте сплайсинга 5P.
Что такое интроны группы II?
Интроны группы II представляют собой тип саморасщепляющихся интронов, обнаруженных в организмах, принадлежащих ко всем трем доменам. Это рибозимы, которые катализируют свои собственные реакции сплайсинга пре-мРНК. Они обнаружены в рРНК, тРНК и генах, кодирующих белок. Но они не обнаружены в ядерных геномах, в отличие от интронов группы I.
Рисунок 02: Интроны группы II
Интроны группы II катализируют сплайсинг посредством двух стадий переэтерификации, подобных интронам группы I. Эти ферменты инициируют реакцию сплайсинга путем нуклеофильной атаки 2'-ОН аденозина сайта разветвления на 5'-соединение сплайсинга. Во время реакций сплайсинга интроны группы II образуют лариатоподобную структуру. Более того, сплайсинг интронов происходит в отсутствие GTP.
Каковы сходства между интронами группы I и группы II?
- Интроны группы I и группы II представляют собой два типа ферментов РНК, рибозимы, которые катализируют собственный сплайсинг с помощью различных механизмов.
- Это большие рибозимы.
- Оба находятся во всех трех доменах.
- Это мобильные элементы.
- Более того, они обнаружены в рРНК, тРНК и генах, кодирующих белки.
- Оба фермента используются в качестве инструментов в биотехнологии и молекулярной медицине для целенаправленного нокаута/нокдауна генов, доставки генов или систем генной терапии.
В чем разница между интронами группы I и группы II?
Интроны группы I представляют собой рибозимы, обнаруженные в бактериях, бактериофагах, органелларных и ядерных геномах эукариот. Интроны группы II представляют собой рибозимы, встречающиеся у бактерий, архей и эукариотических органелл. Кроме того, интроны группы I инициируют реакцию сплайсинга за счет нуклеофильной атаки 3'-гидроксила кофактора гуанозина в сайте сплайсинга 5P, в то время как интроны группы II инициируют реакцию сплайсинга за счет нуклеофильной атаки 2'-ОН аденозина сайта ветвления на сайт сплайсинга 5P. 5' стыковое соединение. Итак, в этом ключевое различие между интронами группы I и группы II.
Кроме того, интроны группы II образуют лариатоподобную структуру во время сплайсинга, в то время как интроны группы I не образуются. Таким образом, это еще одно существенное различие между интронами группы I и группы II. Кроме того, интроны группы I обнаружены в ядерных геномах эукариот, тогда как интроны группы II не обнаружены в ядерных геномах эукариот.
Ниже в инфографике перечислены различия между интронами группы I и группы II в табличной форме для параллельного сравнения.
Резюме – Интроны группы I и группы II
Интроны группы I и II представляют собой большие рибозимы, которые катализируют реакцию переэтерификации, чтобы сплайсировать интроны из первичного транскрипта. Они встречаются во всех трех доменах. Оба они являются мобильными генетическими элементами. Кроме того, они используются в качестве инструментов в биотехнологии и молекулярной медицине. Однако интроны группы I инициируют реакцию сплайсинга за счет нуклеофильной атаки 3'-ОН кофактора гуанозина в сайте сплайсинга 5P. Но интроны группы II инициируют реакцию сплайсинга за счет нуклеофильной атаки 2'-ОН аденозина сайта разветвления на 5'-соединение сплайсинга. Более того, интроны группы II образуют лариатоподобную структуру во время сплайсинга, в то время как интроны группы I не образуют лариатоподобную структуру. Таким образом, это краткое изложение различий между интронами группы I и группы II.
