Агароза против полиакриламида
Агароза и полиакриламид являются водорастворимыми полимерами, но между ними можно увидеть много различий, начиная с их происхождения. И агароза, и полиакриламид имеют нечто общее в своей способности образовывать пористые гелевые матрицы. Несмотря на это, между ними существует ряд явных различий. Основные различия между обоими этими полимерами заключаются в природе их происхождения, химической структуре, различном использовании и их характеристиках с точки зрения гель-электрофореза.
Что такое агароза?
Агароза представляет собой встречающийся в природе линейный полимер, который, в свою очередь, получен из сложного полимера, называемого агаром, который содержится в морских водорослях. Агарозу извлекают из агара путем удаления его белкового компонента, называемого агаропектин. Агароза - это то, что придает агару способность образовывать гели.
Агароза в основном используется в микробиологических и молекулярно-биологических исследованиях. В микробиологических исследованиях агароза при добавлении подходящих питательных веществ обеспечивает прочную основу для культивирования микроорганизмов, таких как бактерии и грибы. При использовании в полутвердых концентрациях он может быть полезен для оценки подвижности этих микроорганизмов. В молекулярной биологии он служит важным инструментом для одного из самых фундаментальных процессов разрешения, называемого «гель-электрофорез» или «электрофорез в агарозном геле» (AGE). Гель-электрофорез - это процесс, который позволяет разделять или разделять нуклеиновые кислоты или белки в зависимости от их размера и заряда. Здесь агароза служит пористым решетчатым гелем, через который происходит разделение.
Структура агарозы
Что такое полиакриламид?
Полиакриламид является синтетическим полимером и используется в самых разных отраслях промышленности. Как упоминалось ранее, его использование зависит от его способности образовывать гели. Однако, в дополнение к этому, его способность удерживать и отводить воду в различных концентрациях также используется в различных отраслях промышленности.
Наиболее распространенное и обычное применение полиакриламида – очистка сточных вод. Здесь он используется в качестве флокулянта для удаления любого взвешенного органического материала; следовательно, улучшение мутности и осветление воды. Еще одним применением полиакриламида является бумажная промышленность. Здесь он используется для удержания или отвода воды из бумажной массы по мере необходимости. Точно так же в сельском хозяйстве и строительстве он используется в качестве кондиционера почвы для предотвращения эрозии почвы и улучшения ее качества.
Как и агароза, полиакриламид также используется в молекулярной биологии в качестве важного инструмента разрешения в аналогичном процессе, называемом «электрофорез в полиакриламидном геле» (PAGE). В дополнение ко всему этому полиакриламид также используется при переработке руды и производстве флокулянта для удаления любого взвешенного органического материала; следовательно, улучшение мутности и осветление воды. Еще одним применением полиакриламида является бумажная промышленность. Здесь он используется для удержания или отвода воды из бумажной массы по мере необходимости. Точно так же в сельском хозяйстве и строительстве он используется в качестве кондиционера почвы для предотвращения эрозии почвы и улучшения ее качества. В дополнение ко всему этому, полиакриламид также используется в производстве пищевых добавок, мягких контактных линз и текстиля.
Полиакриламид Структура
В чем разница между агарозой и полиакриламидом?
Происхождение агарозы и полиакриламида:
Агароза: Агароза представляет собой полимер природного происхождения. Его получают из морских водорослей.
Полиакриламид: Полиакриламид имеет синтетическое происхождение и не встречается ни в каких природных условиях.
Молекулярная формула агарозы и полиакриламида:
Агароза: молекулярная формула агарозы C24H38O19.
Полиакриламид: Молекулярная формула полиакриламида: (C 3H5NO)n.
Химическая структура агарозы и полиакриламида:
Агароза: Агароза представляет собой линейный полисахарид. Он состоит из повторяющихся единиц дисахарида, называемых агробиозой, соединенных водородными связями.
Полиакриламид: Полиакриламид представляет собой химически сшитый полимер. Он состоит из мономеров акриламида и сшивающего агента N, N’-метиленбисакриламида.
Токсичность агарозы и полиакриламида:
Агароза: И агароза, и ее мономерная единица агробиоза нетоксичны по своей природе.
Полиакриламид: мономер полиакриламида, акриламид, является предполагаемым канцерогеном и известным нейротоксином, в то время как его полимеризованная форма нетоксична по своей природе.
Характеристики агарозных и полиакриламидных гелей:
ВОЗРАСТ и СТРАНИЦА:
Агароза: приготовление агарозного геля для AGE требует меньше времени, легко и просто и не требует инициатора или катализатора полимеризации.
Полиакриламид: Приготовление полиакриламидного геля для ПААГ отнимает много времени и утомительно, а также требует инициатора (персульфат аммония) и катализатора полимеризации (N, N, N', N'-тетраметилэтилендиамин – TEMED).
Природа:
Полиакриламидные гели химически более стабильны, чем агарозные гели.
Размер пор:
При одинаковой концентрации матрицы из полиакриламидного геля, как правило, имеют меньший размер пор по сравнению с матрицей из агарозного геля.
Изменение размера пор:
Размер пор полиакриламидных гелей можно изменять более контролируемым образом, чем у агарозных гелей.
Разрешающая способность:
Гели полиакриламида имеют высокую разрешающую способность, а гели агарозы имеют низкую разрешающую способность.
Аккомодирующая нуклеиновая кислота:
Полиакриламидные гели могут содержать большее количество нуклеиновой кислоты, чем агарозные гели для разделения.
