Ключевое различие между выделением геномной ДНК и выделением плазмидной ДНК заключается в том, что выделение геномной ДНК направлено на выделение геномной ДНК, в то время как выделение плазмидной ДНК нацелено на выделение плазмидной ДНК бактерий.
Выделение ДНК - это химический процесс, используемый для выделения ДНК разных видов или разных образцов. Выделение ДНК важно в последующих методах молекулярной биологии, таких как гель-электрофорез, полимеразная цепная реакция и методы секвенирования ДНК. Таким образом, выделение ДНК является важным химическим процессом в молекулярно-биологических исследованиях. Исходя из цели исследования, иногда необходимо выделить геномную ДНК. Кроме того, некоторые исследования сосредоточены на выделении плазмидной ДНК из бактерий. Выделение геномной ДНК - это процесс выделения геномной ДНК из прокариотического или эукариотического образца. Этапы выделения различаются в зависимости от типа клетки, в которой выделяется ДНК. Выделение плазмидной ДНК - это процесс выделения плазмидной ДНК из бактериальной клетки. По сравнению с выделением геномной ДНК общий процесс выделения плазмидной ДНК является сложным.
Что такое изоляция геномной ДНК?
Выделение геномной ДНК - это процесс выделения всей геномной ДНК организма. Этот конкретный процесс включает в себя три основных события. Это лизис клеток или лизис ядер, деградация белков или протеолиз и преципитация геномной ДНК. Этап лизиса может отличаться в зависимости от типа клеток. У прокариот, поскольку имеется пептидогликановая клеточная стенка, первым шагом должно быть разрушение клеточной стенки. С другой стороны, у эукариот этап лизиса включает разрушение плазматической мембраны и ядерной мембраны, чтобы вывести ДНК наружу. Напротив, для лизиса клеточных стенок растений и грибов необходимы специальные шаги.
Рисунок 01: Выделение геномной ДНК
Следовательно, как только этап лизиса завершится, в конце концов ДНК попадет в супернатант. Одновременно в растворе также происходит деградация белка за счет добавления протеиназы К. Следующим шагом является отделение геномной ДНК и расщепленных белков друг от друга. Следовательно, деградированные белки отделяются путем осаждения, что позволяет геномной ДНК оставаться в супернатанте. После осаждения белков геномную ДНК можно осадить и повторно суспендировать в подходящем буфере до тех пор, пока она не потребуется для эксперимента.
Геномная ДНК, представляющая собой линейную ДНК, содержит всю генетическую информацию организма. Другими словами, геном - это наследственный материал живого организма, который отвечает за всю структурную и функциональную активность клетки. Он состоит как из кодирующих, так и из некодирующих последовательностей ДНК. При выделении геномной ДНК она включает весь геном организма.
Что такое выделение плазмидной ДНК?
Выделение плазмидной ДНК – это особый и более сложный процесс выделения ДНК. Плазмиды представляют собой внехромосомную ДНК, присутствующую в большинстве бактериальных клеток. Они представляют собой спящую кольцевую ДНК, которая помогает бактериям выживать в суровых условиях окружающей среды. Плазмидная ДНК состоит из особых генов устойчивости, которые обеспечивают дополнительные преимущества бактерий, такие как устойчивость к антибиотикам, свойства вирулентности и токсические свойства.
Рисунок 02: Выделение плазмидной ДНК
Выделение плазмидной ДНК также включает три основных процесса; лизис клеток, протеинолиз и осаждение ДНК. Хотя биохимический механизм выделения аналогичен механизму выделения геномной ДНК, этот процесс сложнее. Процесс лизиса клеток является наиболее важным процессом в этой процедуре. Самое главное, геномную ДНК и плазмидную ДНК нельзя смешивать друг с другом. Поэтому в процедуру выделения плазмидной ДНК включается гораздо более мягкий процесс лизиса. Следовательно, в большинстве процедур выделения плазмидной ДНК используется детергент; додецилсульфат натрия для лизиса клеток.
Каковы сходства между геномной ДНК и изоляцией плазмидной ДНК?
- Выделение геномной ДНК и плазмидной ДНК направлено на выделение ДНК организма.
- Кроме того, оба следуют одному и тому же общему процессу, который включает в себя лизис клеток, деградацию белка и преципитацию ДНК.
- Кроме того, полученная ДНК обоих процессов важна для последующих процессов.
- Более того, оба процесса выделения включают этапы очистки и хранения ДНК в определенных условиях хранения.
- Кроме того, протеиназа К используется в обоих методах для расщепления белков.
В чем разница между геномной ДНК и изоляцией плазмидной ДНК?
Выделение геномной ДНК фокусируется на извлечении всей геномной ДНК целевого организма, в то время как выделение плазмидной ДНК фокусируется на выделении только плазмидной ДНК из конкретных видов бактерий. Следовательно, в этом ключевое различие между выделением геномной ДНК и плазмидной ДНК. Более того, еще одно различие между выделением геномной ДНК и плазмидной ДНК заключается в процедуре. Выделение геномной ДНК является менее сложной процедурой по сравнению с выделением плазмидной ДНК. Следовательно, при выделении плазмидной ДНК необходимо принимать меры предосторожности для предотвращения смешения геномной и плазмидной ДНК друг с другом.
Нижеприведенная инфографика предоставляет дополнительную информацию о разнице между изоляцией геномной ДНК и плазмидной ДНК.
Резюме – Сравнение геномной ДНК и выделения плазмидной ДНК
Выделение ДНК является важным процессом в методах молекулярной биологии. Существует два типа ДНК, а именно геномная ДНК и плазмидная ДНК (внехромосомная ДНК). В соответствии с требованием некоторые процедуры проводились для выделения геномной ДНК, в то время как некоторые процедуры были направлены на выделение только плазмидной ДНК из бактерий. Таким образом, этапы обоих процессов немного отличаются друг от друга. Тем не менее, общий процесс одинаков в обеих изоляциях. Изолированная ДНК обоих процессов имеет огромное применение в последующих процессах, таких как клонирование, гель-электрофорез и полимеразные цепные реакции. В конце протокола выделения геномной ДНК вся геномная ДНК организма может быть выделена в качестве конечного продукта, в то время как в конце протокола выделения плазмидной ДНК в качестве конечного продукта может быть выделена плазмидная ДНК соответствующей бактерии. Следовательно, в этом разница между выделением геномной ДНК и плазмидной ДНК.
