Ключевое различие между 1D и 2D гель-электрофорезом заключается в свойствах, используемых для разделения белков при гель-электрофорезе. 1D-гель-электрофорез разделяет белки только по молекулярной массе, тогда как 2D-гель-электрофорез разделяет белки по изоэлектрической точке и молекулярной массе.
Разделение белков с помощью гель-электрофореза является важным методом для характеристики белков. Белки имеют различные свойства; поэтому разделение является более сложным по сравнению с разделением ДНК с помощью электрофореза в агарозном геле.
Что такое одномерный гель-электрофорез?
1D Гель-электрофорез, также известный как одномерный гель-электрофорез, представляет собой метод разделения белков на основе молекулярной массы. Разделение белков в основном происходит с помощью электрофореза в полиакриламидном геле. Основываясь на концепции гель-электрофореза, молекулы разделяются в зависимости от их молекулярной массы и заряда.
Поэтому, чтобы придать белкам равномерный заряд, перед гель-электрофорезом проводят обработку додецилсульфатом натрия (SDS). SDS денатурирует белки и придает белку равномерный отрицательный заряд; когда имеет место приложение электрического поля, белки мигрируют к положительному выводу в зависимости от их молекулярной массы. Таким образом, при разделении рассматривается только одно свойство. Вот почему этот метод называется одномерным гель-электрофорезом.
Рисунок 01: Одномерный гель-электрофорез
Во время одномерного гель-электрофореза белки разделяются на основе их молекулярной массы. В связи с этим молекулы с меньшей массой быстрее мигрируют в геле по сравнению с белками с высокой молекулярной массой. Таким образом, белки с большим весом остаются вблизи лунок.
Что такое 2D гель-электрофорез?
2D гель-электрофорез или двумерный гель-электрофорез разделяют белки на основе двух свойств. Двумя свойствами являются изоэлектрическая точка белка и молекулярная масса. Этот метод разделения белков увеличивает разрешение разделения белков. Изоэлектрическая точка белка зависит от pH, при котором белок нейтрален.
Рисунок 02: 2D-гель-электрофорез
Таким образом, при двумерном гель-электрофорезе белку позволяют работать при фиксированном градиенте pH в первом измерении. Во втором измерении белки разделяют с помощью вертикального или горизонтального электрофореза в полиакриламидном геле. Таким образом, белки разделяются в соответствии с их молекулярной массой во втором измерении.
Кроме того, этот метод гель-электрофореза увеличивает разрешение разделения белков. Следовательно, разделенные белки более чистые. Однако стоимость метода намного выше, чем одномерный гель-электрофорез.
В чем сходство между 1D и 2D гель-электрофорезом?
- Оба метода разделяют белки.
- Следовательно, они важны для характеристики белков.
В чем разница между 1D и 2D гель-электрофорезом?
Ключевое различие между одномерным и двухмерным гель-электрофорезом заключается в том, что одномерный гель-электрофорез разделяет белки только по молекулярной массе, тогда как двухмерный гель-электрофорез разделяет белки как по изоэлектрической точке, так и по молекулярной массе. Из-за этого основного различия между одномерным и двухмерным гель-электрофорезом разрешение разделения белков и стоимость этих двух методов также различаются.2D-гель-электрофорез показывает более высокое разрешение, чем 1D-гель-электрофорез. Однако 2D-гель-электрофорез дороже, чем 1D-гель-электрофорез.
Ниже в инфографике представлена разница между 1D и 2D гель-электрофорезом.
Резюме – 1D и 2D гель-электрофорез
Разделение белков зависит от многих факторов. Одномерный гель-электрофорез разделяет белки только по молекулярной массе. Однако двумерный или двумерный гель-электрофорез увеличивает разрешение разделения белков. Кроме того, двухмерный гель-электрофорез разделяет белки на основе изоэлектрической точки и молекулярной массы. Поэтому эти данные важны для последующего процессинга белков и в области протеомики. Таким образом, это краткое изложение различий между 1D и 2D гель-электрофорезом.