Ключевое различие между CDS и кДНК заключается в том, что CDS или кодирующая последовательность является частью транскрипта, которая фактически транслируется в белок, в то время как последовательность кДНК представляет собой последовательность ДНК, полученную из мРНК путем обратной транскрипции.
Ген представляет собой последовательность нуклеотидов, которая кодирует белок. Он состоит из различных областей, таких как промоторная область, сайт инициации транскрипции, экзоны, инициирующий кодон, интроны и стоп-кодон. Следовательно, ген имеет как кодирующие, так и некодирующие последовательности. Кодирующие последовательности или CDS относятся к экзонам и двум кодонам, которые представляют собой стартовый кодон и стоп-кодон. Это последовательность, которая фактически транслируется в белок. Напротив, кДНК представляет собой последовательность ДНК, полученную из мРНК путем обратной транскрипции.
Что такое CDS?
CDS или кодирующая последовательность - это часть гена, которая фактически транслируется в белок. Он состоит из экзонов и двух кодонов, таких как кодон AUG и стоп-кодон. В отличие от кДНК, CDS не содержит двух нетранслируемых участков: 5'-UTR и 3'-UTR. Более того, интроны не включены в CDS.
Рисунок 01: Последовательность кодирования
По сравнению со всем геномом и индивидуумом кодирующие последовательности составляют небольшую долю. Кодирующая последовательность состоит из необходимой последовательности нуклеотидов, чтобы составить аминокислотную последовательность белка.
Что такое кДНК?
кДНК или комплементарная ДНК представляет собой последовательность ДНК, полученную из последовательности мРНК. Он синтезируется в процессе, называемом обратной транскрипцией. Фермент обратная транскриптаза катализирует синтез кДНК, а последовательность мРНК действует как матрица для синтеза кДНК. По сути, мРНК эукариотических клеток можно выделить и очистить для получения кДНК. После конструирования кДНК из мРНК их затем можно клонировать в бактериальную клетку для создания библиотек кДНК. Библиотеки кДНК важны для анализа кодирующих областей, функций генов и экспрессии генов и т. д.
Рисунок 02: кДНК
В отличие от кодирующей последовательности, кДНК содержит две UTR: 3’ UTR и 5’ UTR. Подобно кодирующей последовательности, кДНК не содержит интронов.
Каковы сходства между CDS и кДНК?
- CDS и кДНК являются нуклеиновыми кислотами.
- Они состоят из дезоксирибонуклеотидов.
- И CDS, и CDNA не содержат интронов, которые являются некодирующими областями.
- Оба содержат генетический код или информацию для производства белка.
В чем разница между CDS и кДНК?
CDS или кодирующая последовательность - это часть гена, которая фактически транслируется в белок. С другой стороны, последовательность кДНК представляет собой последовательность ДНК, полученную из мРНК путем обратной транскрипции. Итак, в этом ключевое различие между CDS и кДНК. Кроме того, CDS состоит из экзонов и двух кодонов, стартового и стоп-кодона. Напротив, кДНК состоит из полной последовательности мРНК и двух UTR.
Более того, синтез кДНК осуществляется искусственно из мРНК путем обратной транскрипции, тогда как CDS обнаруживаются в геномной ДНК.
Ниже на инфографике показано больше сравнений, чтобы увидеть разницу между CDS и кДНК.
Резюме – CDS против кДНК
Кодирующая последовательность и кДНК представляют собой два типа нуклеотидных последовательностей. Кодирующая последовательность находится внутри гена, а кДНК синтезируется искусственно. Кодирующая последовательность имеет экзоны и два кодона, тогда как кДНК имеет последовательность мРНК и две UTR. И CDS, и кДНК имеют только нуклеотидные последовательности, которые фактически транслируются в белок. Они не содержат интронов. В отличие от CDS, процесс синтеза кДНК требует фермента обратной транскриптазы. Кроме того, кДНК может преобразовываться в библиотеки кДНК. Таким образом, это суммирует разницу между CDS и кДНК.
