Разница между сохраненной и согласованной последовательностями

Оглавление:

Разница между сохраненной и согласованной последовательностями
Разница между сохраненной и согласованной последовательностями

Видео: Разница между сохраненной и согласованной последовательностями

Видео: Разница между сохраненной и согласованной последовательностями
Видео: Аннотация промотерных последовательностей (Татьяна Татаринова, University of Southern California) 2024, Ноябрь
Anonim

Ключевое различие между консервативной и согласованной последовательностями заключается в том, что консервативная последовательность относится к аналогичным последовательностям нуклеиновых кислот или аминокислот, которые встречаются у разных или одних и тех же видов на протяжении поколений, в то время как консенсусная последовательность представляет собой часто встречающуюся последовательность нуклеотидов или найденную аминокислотную последовательность. в высококонсервативной области ДНК, РНК или белка.

Организмы имеют как схожие, так и разные характеристики. При изучении взаимоотношений между организмами и их классификации очень важен геном или генетический состав организмов. Некоторые нуклеотидные или аминокислотные последовательности являются общими для разных организмов. Консервативная последовательность представляет собой последовательность нуклеиновой кислоты или аминокислоты, которая одинакова для разных видов. Следовательно, они филогенетически важны при создании филогенетических деревьев. В консервативных последовательностях чаще встречаются специфические последовательности нуклеотидов. Они известны как консенсусные последовательности.

Что такое консервативная последовательность?

Консервативной последовательностью является последовательность нуклеиновой кислоты или аминокислотная последовательность, сходная у разных видов. Таким образом, он одинаков для всех видов на протяжении всей эволюции. Как правило, эти последовательности поддерживаются естественным отбором. Они остаются неизменными далеко позади филогенетического дерева. Следовательно, консервативные последовательности важны при построении филогенетических деревьев. Считается, что высококонсервативные последовательности часто имеют важное функциональное значение. Они также полезны для выявления генетических заболеваний. Однако консервативные последовательности могут быть кодирующими или некодирующими последовательностями нуклеиновых кислот. Кроме того, консервативные последовательности демонстрируют более низкую скорость мутаций. Следовательно, они показывают очень минимальные изменения в своем составе; иногда они не показывают изменений во всех поколениях.

Разница между сохраненной и согласованной последовательностями
Разница между сохраненной и согласованной последовательностями

Рисунок 01: Сохраненная последовательность

РНК-компоненты рибосом присутствуют во всех областях жизни, гомеобоксные последовательности у эукариот и тмРНК у бактерий являются несколькими примерами высококонсервативных последовательностей. Идентификация консервативных последовательностей проста, когда используются подходы биоинформатики, особенно инструмент выравнивания последовательностей. Более того, множественное выравнивание последовательностей облегчает визуализацию консервативных последовательностей.

Что такое консенсусная последовательность?

Консенсусная последовательность - это последовательность, которая обычно встречается в данной консервативной области ДНК или РНК. Это очень специфическая последовательность нуклеотидов. Например, существует консенсусная последовательность в -10 как ТАТААТ (бокс Прибнова) в промоторах E. coli, которые представляют собой высококонсервативные последовательности. Точно так же существует другая консенсусная последовательность: TTGACA в промоторах E. coli также на -35. Консенсусные последовательности также известны как «ящики».

Ключевая разница - сохраненная и согласованная последовательность
Ключевая разница - сохраненная и согласованная последовательность

Рисунок 02: Согласованная последовательность

В дополнение к ДНК и РНК белки также имеют консенсусные последовательности аминокислот. Сайты связывания белков часто представлены консенсусными последовательностями. Ферменты рестрикции также имеют консенсусные последовательности. Более того, сайты сплайсинга также являются консенсусными последовательностями. Подобно консервативным последовательностям, консенсусные последовательности можно рассчитать и визуализировать с помощью инструментов биоинформатики.

Каковы сходства между консервативной и консенсусной последовательностями?

  • Консервативные и консенсусные последовательности представляют собой последовательности нуклеиновых кислот или аминокислот, общие для разных видов.
  • Как консервативные, так и консенсусные последовательности могут быть визуализированы с помощью инструментов биоинформатики.
  • Они широко используются в молекулярной биологии.

В чем разница между сохраненной и согласованной последовательностями?

Консервативная последовательность представляет собой последовательность нуклеиновой кислоты или аминокислоты, которая согласуется между видами, в то время как консенсусные последовательности представляют собой очень специфичные и часто встречающиеся основания или аминокислоты в данной консервативной области. Итак, в этом ключевое различие между консервативной и консенсусной последовательностями. Более того, еще одно различие между консервативной и консенсусной последовательностями заключается в том, что консервативные последовательности являются филогенетически важными, в то время как консенсусные последовательности часто представляют собой сайты связывания белка, сайты сплайсинга, сайты разрезания ферментами рестрикции и т. д.

Разница между сохраненной и согласованной последовательностями в табличной форме
Разница между сохраненной и согласованной последовательностями в табличной форме

Резюме – Последовательность сохранения и консенсуса

Консервативные последовательности - это последовательности нуклеиновых кислот или белков, сходные между живыми видами. Промотор, сайт связывания рибосомы, точка начала репликации и аминокислотная последовательность гистонового белка являются несколькими примерами консервативных последовательностей. Напротив, консенсусные последовательности представляют собой определенные основания или аминокислоты, которые чаще встречаются в данной консервативной последовательности. -10 бокс, -35 бокс промотора E. coli, сайты связывания белка, сайты сплайсинга и сайты, узнающие ферменты рестрикции, являются несколькими примерами консенсусных последовательностей. Таким образом, это краткое изложение различий между консервативной и согласованной последовательностями.

Рекомендуемые: