Ключевое различие между dATP и ddATP заключается в том, что dATP не останавливает синтез ДНК, в то время как ddATP способен останавливать синтез ДНК. Это связано с тем, что ddATP имеет атом H, присоединенный к 3'-положению пентозного сахара, в то время как dATP имеет группу OH, присоединенную к 3'-положению.
dNTP являются строительными блоками ДНК. Существует четыре типа дНТФ в зависимости от пуриновых или пиримидиновых оснований - дАТФ один из них. Азотистое основание дАТФ представляет собой аденозин. ddNTP - это нуклеотиды, используемые в секвенировании по Сэнгеру. Существует четыре типа ddNTP. ddATP - это ddNTPs.
Что такое дАТФ?
Деоксиаденозинтрифосфат - это нуклеотид, который является строительным блоком ДНК. Фермент ДНК-полимераза использует дАТФ в качестве субстрата для синтеза ДНК. дАТФ состоит из трех компонентов: молекулы сахара дезоксирибозы, аденозина и трех фосфатных групп. Следовательно, это пуриновый нуклеозидтрифосфат. Химическая формула dATP: C10H16N5O12 P3, и его молекулярная масса 491,182.
Рисунок 01: дАТФ
dATP отличается от АТФ (аденозинтрифосфата) сахарными компонентами. АТФ содержит рибозный сахар. Пары оснований dATP с урациловым нуклеотидом во время транскрипции. Помимо участия в синтезе ДНК, dATP может действовать как молекула, передающая энергию, для поддержания жизнеспособности клеток. Высокий уровень дАТФ в организме токсичен, поскольку он может действовать как неконкурентный ингибитор фермента рибонуклеотидредуктазы. Это может привести к нарушению иммунной функции.
Что такое ддАТФ?
Дидезоксиаденозинтрифосфат или ддАТФ является одним из четырех типов нуклеотидов, используемых в методе секвенирования по Сэнгеру. Структурно ддАТФ также имеет три компонента, сходных с дАТФ. Они представляют собой основание аденина, сахар дезоксирибозу и три фосфата.
Рисунок 02: ddATP
В отличие от dATP, ddATP не имеет ОН-группы в 3'-положении пентозного сахара, чтобы образовать фосфодиэфирную связь с соседним нуклеотидом и продолжить удлинение цепи. Он имеет атом H в 3'-положении. Следовательно, как только ddATP включается, синтез ДНК заканчивается. Это основной принцип секвенирования по Сэнгеру. Следовательно, ddATP работает как ингибитор удлинения цепи при секвенировании по Сэнгеру. В секвенировании по Сэнгеру используются четыре пробирки, и в одну из них добавляется ддАТФ.
Каковы сходства между dATP и ddATP?
- dATP и ddATP являются нуклеотидами.
- Оба состоят из аденина, дезоксирибозы и трех фосфатов.
- Это органические соединения.
- И dATP, и ddATP добавляют в пробирки при секвенировании по Сэнгеру.
В чем разница между dATP и ddATP?
dATP имеет OH-группу в 3'-положении пентозного сахара, в то время как ddATP не имеет OH-группы в 3'-положении пентозного сахара. Кроме того, dATP является мономером, используемым в синтезе ДНК, в то время как ddATP используется для прекращения удлинения цепи во время секвенирования по Сэнгеру. Итак, в этом ключевое различие между dATP и ddATP. Кроме того, dATP может образовывать фосфодиэфирные связи, в то время как ddATP не может образовывать фосфодиэфирные связи.
Ниже на инфографике показано больше различий между dATP и ddATP в табличной форме для параллельного сравнения.
Резюме – дАТФ против ддАТФ
Вкратце, dATP является предшественником синтеза ДНК, в то время как ddATP является нуклеотидом, используемым для терминации синтеза ДНК в секвенировании по Сэнгеру. Кроме того, dATP имеет ОН-группу в 3'-положении пентозного сахара, что позволяет образовывать фосфодиэфирную связь со следующим нуклеотидом. Между тем у ddATP отсутствует ОН-группа в 3'-положении; следовательно, он не может образовать фосфодиэфирную связь со следующим нуклеотидом. В результате последовательность ДНК перестает удлиняться. Таким образом, это суммирует разницу между dATP и ddATP.