Ключевое различие между репликативной транспозицией и транспозицией вырезания и вставки заключается в том, что при репликативной транспозиции транспозон копируется в новое место, а при транспозиции вырезания и вставки транспозон перемещается в новое место.
Мобильные элементы или прыгающие гены - это последовательности ДНК, которые могут менять свое положение в геноме. Это называется транспозицией. Транспозиция иногда может создавать или отменять мутации и изменять генетическую идентичность клетки и размер генома. Транспозиция была открыта Барбарой МакКлинток в 1983 году. Транспозиция может выполняться с помощью двух методов: дублирования и вырезания и вставки.
Что такое репликативная транспозиция?
Репликативная транспозиция - это тип механизма транспозиции, который помогает вырезать транспозоны из нативного местоположения в другое с помощью техники репликации или дублирования. Этот механизм был впервые обнаружен Джеймсом А. Шапиро в 1979 году. В этом механизме мобильный элемент дублируется во время реакции транспонирования, так что транспонирующий объект является копией исходного элемента. Более того, в этом механизме последовательности ДНК донора и рецептора образуют характерную промежуточную «тета»-конфигурацию, называемую интермедиатом Шапиро (коинтегратом). Репликативная транспозиция является характерным ретротранспозоном. Этот механизм обычно происходит в транспозонах класса I.
Рисунок 01: Репликативная транспозиция
Хороший пример репликативной транспозиции можно наблюдать в транспозоне TN3 E. coli. Транспозон TN3 может перемещаться из исходной плазмиды в другую плазмиду-мишень с помощью техники репликации или дублирования. Все это событие опосредовано двумя важными ферментами, называемыми транспозазой и резольвазой. Более того, репликативную транспозицию можно наблюдать как в ДНК-транспозонах, так и в ретропозонах. Наиболее изученным мобильным бактериальным вирусом является бактериофаг Mu.
Что такое транспозиция вырезания и вставки?
Транспозиция «Вырезать и вставить» - это тип механизма транспозиции, который помогает вырезать транспозоны из исходного местоположения в другое с помощью техники вырезания и вставки. Этот механизм также известен как консервативная модель транспозиции. При этой нерепликативной транспозиции вырезание и интеграция транспозона из одного геномного местоположения в другое происходят без оставления копии.
Рисунок 02: Вырезать и вставить транспонирование
В этом механизме фермент транспозаза сначала связывается с терминальными повторами, которые обычно присутствуют на обоих концах транспозонов, а затем образует структуру, называемую синаптическим комплексом (транспозосомой). Синаптический комплекс отделяет транспозон от его исходного положения в геноме и интегрирует его в новое место-мишень. После этого транспозазы отходят с обоих концов транспозона. Как только фермент транспозаза покидает транспозон, промежутки заполняются ферментом полимеразой-хозяином. Это позволяет полностью присоединить транспозон к новому местоположению в геноме. Этот механизм обычно происходит в транспозонах класса II. Кроме того, бактериальные транспозоны TN5 являются хорошо известным примером, демонстрирующим консервативный механизм транспозиции или механизм вырезания и вставки.
Каковы сходства между репликативной транспозицией и транспозицией вырезания и вставки?
- Репликативная транспозиция и транспозиция вырезания и вставки - это два типа механизмов транспозиции.
- В обоих механизмах мобильные элементы перемещаются из одного геномного местоположения в другое новое геномное местоположение.
- Оба механизма могут создавать или отменять мутации и изменять генетическую идентичность клетки.
- Бактериальные транспозоны показывают оба механизма.
- Это чрезвычайно важные события для эволюции.
В чем разница между репликативной транспозицией и транспозицией вырезания и вставки?
Репликативная транспозиция - это тип механизма транспозиции, при котором транспозон копируется в новое место, а транспозиция вырезания и вставки - это тип механизма транспозиции, при котором транспозон перемещается в новое место. Таким образом, в этом ключевое различие между репликативной транспозицией и транспозицией вырезания и вставки. Кроме того, репликативная транспозиция обычно происходит в транспозонах класса I, в то время как транспозиция вырезания и вставки обычно происходит в транспозонах класса II.
Приведенная ниже инфографика представляет различия между репликативной транспозицией и транспозицией вырезания и вставки в табличной форме для параллельного сравнения.
Резюме – Репликативная транспозиция против транспозиции вырезания и вставки
Репликативная транспозиция и транспозиция вырезания и вставки - это два типа механизмов транспозиции. Репликативная транспозиция - это тип механизма транспозиции, при котором транспозон копируется в новое место, а транспозиция вырезания и вставки - это тип механизма транспозиции, при котором транспозон перемещается в новое место. Итак, это резюмирует разницу между репликативной транспозицией и транспозицией вырезания и вставки.
